大肠癌唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型研究
1临床资料,2实验方法,3结果,4讨论
贺佐梅,黄飞娟,周小青,吴正治,,4,5*,谢梦洲,2*(1.湖南中医药大学中医诊断国家重点学科,湖南省2011数字中医药协同创新中心,湖南长沙410007;2.抗肿瘤中药创制技术湖南省工程研究中心,湖南长沙410007;3.广东医学院附属福田医院,广东深圳518033;4.深圳大学第一附属医院,广东深圳518035;5.深圳市老年医学研究所,广东深圳518020)
大肠癌唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型研究
贺佐梅1,黄飞娟3,周小青1,吴正治1,3,4,5*,谢梦洲1,2*
(1.湖南中医药大学中医诊断国家重点学科,湖南省2011数字中医药协同创新中心,湖南长沙410007;2.抗肿瘤中药创制技术湖南省工程研究中心,湖南长沙410007;3.广东医学院附属福田医院,广东深圳518033;4.深圳大学第一附属医院,广东深圳518035;5.深圳市老年医学研究所,广东深圳518020)
〔摘要〕目的研究建立大肠癌(colorectal cancer,CRC))唾液蛋白质指纹图谱新型分子诊断模型。方法采集34例肠癌患者、45例健康志愿者(正常组)的唾液标本,用弱阳离子交换型(WCX)纳米磁珠联合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术进行检测,获得各标本的蛋白指纹图谱。用Biomarker Wizard软件分析所获得的蛋白指纹图谱找出差异蛋白,再用Biomarker Patterns 5.0.2建立鉴别诊断模型。结果共检测到312个肠癌差异蛋白质峰,两组比值大于3(肠癌/正常对照>3,或者正常对照/肠癌>3),其中有37个差异蛋白质峰有统计学意义(P<0.05);其中有7个差异蛋白质峰肠癌组表达上调,28个差异蛋白质峰肠癌组表达下调,有35个差异蛋白质峰有显著差异(P<0.01)。筛选建立了由m/z为2 501.26、4 779.95、3 140.39的3个差异蛋白峰组成的肠癌与正常组的诊断模型,该模型的灵敏度和特异度分别为88%(30/34)和98 % (44/45);通过交叉验证法进一步验证诊断模型的可靠性,结果该模型的灵敏度和特异度分别为85% (29/34)和88% (37/45)。结论用WCX结合MALDI-TOF-MS技术建立的唾液蛋白诊断模型为肠癌的诊断提供了新途径。
〔关键词〕大肠癌;唾液;蛋白质组;分子诊断模型;蛋白指纹图谱;基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 ......
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