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编号:441658
基于GEO 基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究火把花根片治疗IgA 肾病的作用机制
http://www.100md.com 2022年8月22日 湖南中医药大学学报 2022年第8期
雷公藤,靶点,通路,1材料与方法,1IgAN的基因芯片及差异分析,2HBHGT成分和靶点筛选,3疾病靶点数据库建立,4HBHGT药物-成分-靶点网络图构建,5核心靶点筛选
     秦苏杨,任秋安,王耀光*

    (1.天津中医药大学第一附属医院,天津 300193;2.国家中医针灸临床医学研究中心,天津 300193)

    IgA 肾病(IgA nephropathy, IgAN)是世界范围内最常见的原发性肾小球疾病, 其特征是循环免疫球蛋白A(immunoglobulin A, IgA)和肾系膜IgA 沉积异常[1-2]。 临床中,其主要表现为无症状血尿(如肉眼血尿、镜下血尿有或无伴随蛋白尿)、进行性肾病(蛋白尿无伴随血尿、肾病综合征),严重者甚至伴随进行性肾衰竭。 不良预后相关因素包括高血压、蛋白尿、表皮生长因子受体降低,发病人群以成年人为主[3]。目前,IgAN 的西医治疗药物以激素以及免疫抑制剂等为主,同时还可通过改善患者生活方式、控制血压、行扁桃体切除术等进行支持治疗。 但激素与免疫抑制剂的价格及不良反应均在一定程度上加重患者的负担[4],因此,利用中医药优势寻找替代疗法显得尤为必要。

    IgAN 在中医学属于“水肿”“肾风”“血尿”“肾着”等范畴,以伏邪、瘀血等理论进行辨证论治,临床常用雷公藤、黄葵及类属中成药[5-7]。火把花根片(HBHGT)是由昆明山海棠根加工而成,目前已证实HBHGT具有良好的免疫调节和抗炎作用[8]。 有临床证据表明,HBHGT 可缓解炎症、减少尿蛋白、延缓IgAN 进展,且其具有无生物毒性的优点[9-11]。 但其治疗IgAN的作用机制尚未十分明确,本文通过生物信息学、网络药理学和分子对接技术手段, 预测潜在作用靶点和信号通路,以期明确作用机制,为临床用药提供参考。

    1 材料与方法

    1.1 IgAN 的基因芯片及差异分析

    在NCBI 的GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds)以“IgA Nephropathy”为关键词检索IgA肾病样本。 选取含IgAN 样本与正常样本的数据集5 组(GSE37460、GSE93798、GSE35489、GSE104948、GSE99340)为研究对象。通过R 4.1.2 进行系统分析并利用normalize 函数进行归一化处理。 用Limma包筛选出差异基因,筛选条件为:logFC 绝对值>1,P<0.05 且校正P<0.05。

    1.2 HBHGT 成分和靶点筛选

    在TCMSP(https://tcmsp-e.com/tcmsp.php)、本草组鉴(http://herb.ac.cn)、BATMAN-TCM(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)查找HBHGT 的化学成分 ......

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