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编号:441557
基于miRNA-mRNA 探讨西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制及预后分析
http://www.100md.com 2022年12月27日 湖南中医药大学学报 2022年第12期
靶点,1资料与方法,1西黄丸干预乳腺癌骨转移miRNA-mRNA互作关系构建,2西黄丸干预乳腺癌骨转移Hub基因筛选及富集分析,3西黄丸干预乳腺癌骨转移Hub基因表达差异分析及数据库验证
     邓显光,刘丽芳,袁 博*

    (湖南中医药大学第一附属医院乳腺科,湖南 长沙 410007)

    乳腺癌是全球第一大恶性肿瘤,发病率11.7%,死亡率6.9%,严重危害女性生命健康[1]。晚期乳腺癌患者中65%~75%发生骨转移,常伴有骨痛、骨相关事件、骨损伤等,治疗上以控制肿瘤进展、缓解疼痛、改善生活质量为原则,在化学药物治疗、内分泌治疗、靶向治疗、免疫治疗等多学科综合治疗控制乳腺癌原发灶的基础上,加用双磷酸盐、地舒单抗等骨改良药物,治疗骨相关事件[2]。 在整体观念、辨证论治理论指导下,中医药治疗乳腺癌骨转移发挥着重要作用,可有效提高乳腺癌患者生存率及生活质量,中西医结合方案具有协同增益的效用[3]。西黄丸作为广谱抗肿瘤中成药,联合唑来膦酸能显著提高乳腺癌骨转移患者的临床疗效及生存质量[4]。 研究表明,miRNA 对乳腺癌的生长以及转移有着重要作用[5],且miRNA 可作为乳腺癌治疗以及生存预后的生物标志物[6]。 miRNA-556-5p 能与靶基因3'UTR相结合,调控乳腺癌细胞的迁移、侵袭和上皮-间质转化,在乳腺癌骨转移中发挥着调控作用[7]。 为进一步明确乳腺癌骨转移分子机制,本研究以西黄丸干预乳腺癌骨转移为切入点,以miRNA-mRNA 互作为落脚点,综合多个数据库信息,采用网络药理学联合生物信息学的方法,明晰西黄丸治疗乳腺癌骨转移的分子机制及药物干预靶点,为乳腺癌骨转移的药物干预靶点及生物标志物的确定提供理论依据。

    1 资料与方法

    1.1 西黄丸干预乳腺癌骨转移miRNA-mRNA 互作关系构建

    通过GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/),分别获取GPL21572 探针的乳腺癌miRNA(GSE143564)与GPL570 探针的基因(GSE42568)表达微阵列数据。 GSE143564 表达矩阵中,将GSM 4262013~GSM4262015 样本分为正常组(Normal 组),GSM4262016~GSM4262018样本分为乳腺癌组(Tumor组);GSE42568 表达矩阵中,将GSM1045191~GSM 1045207样本分为正常组(Normal 组),GSM1045208~GSM1045311 分为乳腺癌组(Tumor 组)。 采用R 语言“limma”包,以log2FC>1 或log2FC<-1,且P<0.05为 筛 选条件[8],差异分析GSE143564、GSE42568 表达矩阵,分别筛选出差异miRNA(differentially expressed microRNAs, DEMs)与差异基因(differentially expressed genes, DEGs) ......

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