闫李侠，黄至澄，徐黔宁，陈保文，王国治

    (1、台州市第一人民医院，浙江台州 318020；2、中国药品生物制品检定所 100050)

    54株分枝杆菌国际参考株16S rRNA序列分析

    闫李侠1，黄至澄1，徐黔宁1，陈保文2，王国治2

    (1、台州市第一人民医院，浙江台州 318020；2、中国药品生物制品检定所 100050)

    目的分析54株分枝杆菌国际参考株16S rRNA序列，为临床分离株的鉴定提供参考。方法用16S rRNA序列分析法对54株分枝杆菌国际参考株进行分析，构建系统发育树，计算相似性百分比。结果除11株(共9种4组)分枝杆菌，即产鼻疽分枝杆菌与塞内加尔分枝杆菌；溃疡分枝杆菌与海分枝杆菌；堪萨斯与胃分枝杆菌；3株结核分枝杆菌与田鼠分枝杆菌、非洲分枝杆菌16S rRNA基因序列完全相同无法相互鉴别，其它41株(共41种)分枝杆菌菌种间16S rRNA均不相同可以得到很好的鉴别。结论16S rRNA基因序列分析是一种很好的鉴定分枝杆菌的方法，国际参考株16S rRNA基因序列的研究弥补了基因数据库的不足。

    分枝杆菌；16S rRNA；序列分析

    rRNA基因被称为细菌的“活化石”，是目前细菌系统发育分类与鉴定的最常用靶基因。rRNA基因存在染色体上，包括长约1.6kb的16S，3.3kb的23S，0.12kb的5S基因。由于16S rRNA基因的长度适中，并且高变区序列具有细菌属、种的特征，因而16S rRNA基因的序列测定已作为细菌分类和鉴定的“金标准”[1]。但16S rRNA基因序列分析定要想成为一种临床检测的常规方法，还需要一个强大的质控序列数据库[2，3]；而目前的数据库还不够完善，甚至数据库的有些信息是错误的[4]，这在一定程度上限制了分子鉴定技术的临床应用性。分枝杆菌国际参考株为国内外分枝杆菌研究的标准对照株，起实验质量控制作用。但到目前为止尚无54株国际参考株16S rRNA基因的系统研究报道。本研究的目的在于分析54株国际参考株16S rRNA基因序列以补充基因库中尚未公布的部分分枝杆菌基因，为实现16S rRNA基因分析方法的常规性提供了重要的基础条件。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    1.1.1 实验菌株：实验所用国际参考菌株54株均由ATCC引进并在中国医学细菌保藏管理中心保藏。 ......