检测PML/RARα基因的双重荧光定量PCR方法的建立
精密度,1材料与方法,2结果,3讨论
江梅,万腊根,简正伟,石淙,张长林(南昌大学第一附属医院检验科,江西 南昌330006)
检测PML/RARα基因的双重荧光定量PCR方法的建立
江梅,万腊根,简正伟,石淙,张长林
(南昌大学第一附属医院检验科,江西 南昌330006)
目的建立在一个反应体系中同时检测融合基因PML/RARα和内参基因ABL的双重荧光定量PCR方法。方法从DNA聚合酶含量、Mg2+浓度和引物浓度等方面进行优化,建立检测PML/RARα和ABL基因双重荧光定量PCR体系,从分析灵敏度,批内、批间精密度以及检测临床样本阳性率等方面对双重荧光定量PCR反应体系进行性能评价,并同时和北京思尔成公司荧光定量PCR试剂盒进行比较,分析两者的一致性。结果成功构建双重荧光定量PCR反应体系,检测质粒灵敏度为103copies/ml,检测NB4细胞的灵敏度为10-3,反应体系批内、批间精密度Ct值的变异系数CV都小于5%,检测20例确诊为APL病人,其检测阳性率,和北京思尔成公司的PCR反应试剂一致。结论成功开发出稳定的双重荧光定量PCR试剂盒,其操作简单,成本低,误差小,能够有效地用于APL分子生物学分型诊断、用药指导、预后观察及MRD监测。
荧光定量PCR;PML/RARα;ABL;急性早幼粒细胞白血病
急性早幼粒细胞白血病 (acute promyelocytic leukemia,APL)是较为常见的急性髓细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML) 的一种特殊类型[1]。研究表明,98%以上的APL病人出现非随机的染色体易位 t(15;17)(q22;q21),造成 PML、RARa 基因重排而形成PML/RARα融合基因[2],该融合基因在APL白血病的发生中起关键作用,同时也成为APL特异性的分子标志。因此对APL病人PML/RARα融合基因的检测成为APL分子生物学分型诊断、用药指导、预后观察及微小残留病 (minimal residual disease,MRD)诊断的重要技术手段[3]。 临床上检测PML/RARα融合基因的方法很多,最常用的是荧光定量RT-PCR,为了实现操作简单,成本低,误差小,本研究拟在已有的工作基础上,建立在一个反应体系中同时检测PML/RARα和ABL的双重荧光定量PCR方法,该方法在一个反应体系中检测两个基因,这样可以减少试剂用量,同时减少操作步骤,大大减少实验成本和实验时间。
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.1.1 材料 RPMI-1640培养基、D-Hanks、FBS购于 Hyclone公司、Trizol、DNA Marker为天根公司产品、RT试剂盒、RNA酶抑制剂为TaKaRa公司产品、实时荧光定量PCR试剂盒购于北京思尔成生物技术有限公司、Tap DNA Polymerase购自Fermentas公司、dNTP和人淋巴细胞分离液购自Solarbio公司、E.coli DH5α 和质粒 PCMV4-PML/RARα-ABL为本室自藏 ......
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