薛洋，曾富春，舒骏，丛伟

    (四川省人民医院胸外科，四川 成都610072)

    福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded，FFPE)组织是目前国内外运用最为广泛的组织保存形式。因为其能够保持组织的特殊形态，而且保存时间较长，能够适合后期的免疫组化和组织学分析，为临床治疗的选择提供可靠的保障。

    目前，分子靶向治疗逐步成为肿瘤治疗的主流，在临床用药前对患者基因突变状态进行检测，可正确指导临床个体化用药，减轻患者经济负担，提高分子靶向药物治疗效果。因此，从FFPE样本中提取高质量的DNA/RNA进行分子靶标检测也逐渐受到关注。从FFPE中提取到能够有效扩增的DNA/RNA不仅适用于回顾性研究，也对疾病的诊断与鉴别、评估疾病预后和探索疾病分子机制具有重要意义[1]。

    但是DNA/RNA在福尔马林固定和石蜡包埋的过程中，都有不同程度的片段化，而且样本大小、固定时间、固定温度和包埋条件等等都对DNA/RNA的质量产生极大的影响。近年来，研究人员试图了解在FFPE样本制备过程中存在着的各种对DNA/RNA的不利因素，找出解决方案，力求提取出高质量的DNA/RNA，用于后续的基因突变分析，还原样本真实的基因信息，以提高FFPE样本在疾病的诊断和预后中的应用价值。

    在2011年发表的《中国非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体基因突变检测专家共识》中，对FFPE样本的处理提出了规范化操作流程，使得各大医院能轻松地完成从FFPE样本中提取到高质量的DNA，用于表皮细胞生长因子受体(EGFR)的基因突变检测，为非小细胞肺癌的靶向治疗提供了重要的临床依据。但是由于环境中存在较多且稳定的RNA酶，导致从FFPE样本中提取完整的RNA较为困难。随着技术的不断完善，国内外出现了许多不同的提取方法，所得RNA的产量及扩增效率也存在着很大差异[2-4]。因此，目前存在着很多质疑：能否从FFPE样本中提取到高质量并且足够多的RNA用于后续的基因突变检测？

    目前尚无文献报道对国内大队列的FFPE样本提取的RNA质量进行分析。因此，本研究从国内不同地区收集了994例FFPE样本，采用厦门艾德生物医药科技有限公司生产的FFPE样品RNA分离试剂盒(2013年获CFDA批准上市)进行RNA分离，对RNA质量进行分析，并将提取的RNA用于EML4-ALK基因融合和ROS1基因融合检测，通过对比测序结果，以此判断采用FFPE样本RNA进行基因突变检测的可靠性。

    1 材料与方法

    1.1 样本来源 收集2010年1月至2013年12月共994例FFPE样本 ......