单核苷酸多态性与2型糖尿病易感基因相关性的研究进展
分型,位点,1SNP概况,2SNP的主要检测平台,3SNP在T2DM易感基因筛选中的应用
杨国宗综述,杨丽阳审校(漳州市中医院检验科,福建 漳州363000)
近年来,随着经济发展和生活方式的改变,2型糖尿病(T2DM)发病率在我国呈现逐渐升高的趋势。T2DM是一种遗传因素和环境因素共同作用而形成的多基因遗传的复杂性疾病,并以胰岛素分泌受损和(或)胰岛素抵抗为主要的临床特点,其遗传方式属于常染色体多基因隐性遗传,由于异常基因的遗传使后代具有糖尿病易感性。随着单核苷酸多态性(SNP)分析技术的发展以及全基因组关联研究结果的相继报道,至今已发现许多常见基因变异与T2DM密切相关,但其病因、发病机制未能完全阐明。据统计,目前全球糖尿病患者约3.66亿,估计到2030年将有5.52亿,其中T2DM 至少占95%以上[1],因此利用高效率、高通量、低成本的SNP分析技术来发现糖尿病易感基因并对其进行相关研究,为T2DM的早期预测并及时做好防治措施具有非常重要的意义。我们以SNP为线索,将其在T2DM发病机制研究中的应用进展作一综述。
1 SNP概况
SNP是指由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性。在遗传学分析中,SNPs作为第三代遗传标记,在科研中得以广泛应用。人类染色体大量存在SNP位点,近年来的研究发现有些SNP引起包括糖尿病、肿瘤等在内的各种疾病相关基因表达,有些SNP不直接导致疾病基因的表达,但由于它与某些疾病的致病基因相邻,也可以作为某些疾病的重要标记,由于存在着 SNP,造成人类对有些疾病的易感性、对药物反应性及耐受性的个体差异。另外,SNP具有的高频性、稳定性特征对疾病发生的相关因素分析也是非常重要[2]。随着现代技术的进步,利用SNP发现疾病相关基因突变比通过家系遗传谱的研究容易得多。由于SNP主要是二等位多态性,在基因组筛选中SNPs只需+/-的分析,而不必分析片段的长度,这有利于筛选或检测SNPs的自动化,达到快速、规模化筛查的目的。SNPs在人群中几乎为双等位基因标记,其等位基因频率容易估计,同时也易于进行基因分型方面研究。
2 SNP的主要检测平台
2.1 低通量 包括限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、单链构象多态性(SSCP)、DNA 测序法、变性高效液相色谱(DHPLC)等,其中以DHPLC技术为主要代表,它是在单链构象多态性和变性梯度凝胶电泳基础上发展起来的一种新的杂合双链突变检测技术,其主要原理是先对目标核酸片段PCR扩增,部分加热变性后,含有突变的DNA序列由于错配碱基与正常碱基不能配对而形成异源双链,通过带正电荷的流动相将带负电荷的DNA分子吸附到固定相上 ......
您现在查看是摘要页,全文长 10664 字符。