长链非编码RNA与肿瘤之间关系的研究进展
肿瘤发生,基因组,1LncRNAs与人类癌症的关系,2致癌LncRNAs,3抑癌LncRNAs,4LncRNAs的诊断优势
张爱兴 综述,王玉明,段 勇 审 校(昆明医科大学第一附属医院检验科,云南昆明650032)
·综述·
长链非编码RNA与肿瘤之间关系的研究进展
张爱兴综述,王玉明,段勇审校
(昆明医科大学第一附属医院检验科,云南昆明650032)
LncRNAs在基因组中普遍转录,其在转录水平、转录后水平和基因调控表观遗传机制中所表现出各种不可小觑的功能,使其成为了肿瘤发生发展过程中新的参与者。在许多肿瘤中,LncRNAs表达的上调或者下调体现其致癌和抑癌的作用,这也暗示其异常表达可能是肿瘤发生发展过程中的实质性因素。本文将概括总结并描述LncRNAs在人类肿瘤中所扮演的新兴角色,并讨论它们作为潜在生物标记物在诊断作用中的远景。
长链非编码RNA;癌症;致癌LncRNAs;抑癌LncRNAs
长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是指广泛存在于哺乳动物细胞中的一类长度大于200nt的非编码序列,它们通常由RNA聚合酶Ⅱ转录形成,因其缺少有效开放阅读框,因此很少编码或者不能编码蛋白质[1,2]。LncRNAs可以通过各种不同的作用机制,如ftRNA-RNA碱基配对、RNA-蛋白质相互作用、RNA-DNA相互作用等,在基因表达调控的各个层面发挥其特有功能,并参与染色质修饰、转录调节、剪切加工、RNA稳定性调节等重要过程。其特点如下[3,4]:(1)LncRNAs具有mRNA样特殊结构,长度通常较长,经过剪接以后具有polyA尾巴与启动子结构,其在分化过程中具有动态表达及不同的剪接方式;(2)LncRNAs启动子同样可以和转录因子结合,如c-myc、Nanog、CREB、Oct3/4、Sox2、Sp1与p53等;(3)大多数LncRNAs在组织分化发育过程中,都具有比较明显的时间空间表达特异性;(4)大多数LncRNAs在肿瘤和其它疾病中都具有比较特殊的表达方式;(5)LncRNAs在序列上的保守性通常较低,只有大约12%的LncRNAs可在人类之外的其它生物中找到。
LncRNAs在漫长的进化中被赋予了复杂的结构、信息等多方面的功能,它通过与DNA、RNA及蛋白质的相互作用,在生命活动调控网络中扮演着极为重要的角色。但迄今为止,LncRNAs起源的确切过程还不是很清楚,目前有以下几类假说:(1) LncRNAs是由编码蛋白质的基因演变而来的,很有可能在早期进化的过程中,原来是编码蛋白质的基因,由于开放阅读框(open reading frame ......
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