梁振山综述，曾令兵，万腊根审校(1、南昌大学医学院，江西南昌0006；2、江西省儿童医院检验科，江西南昌0006；、南昌大学第一附属医院检验科，江西南昌0006)

    基因组测序技术及其临床应用研究进展

    梁振山1，2综述，曾令兵3，万腊根3审校

    (1、南昌大学医学院，江西南昌330006；2、江西省儿童医院检验科，江西南昌330006；3、南昌大学第一附属医院检验科，江西南昌330006)

    摘要：目前，随着全基因组测序技术的进一步发展，基因组测序技术在临床与科研中越来越发挥着重要作用。近几年来，基因组测序技术迅速发展，其在愈来愈受到学者们的关注。本文旨在对基因组及、基因组测序技术及其在临床诊断中的应用做一综述。

    关键词：基因组；基因序列；基因测序技术

    1 基因组及基因测序技术的进展

    从分子生物学角度来讲，双链螺旋结构的DNA分子控制每个生物个体的遗传特性。基因组在生物学中的定义，是指包含该生物体中所有的DNA(有些病毒是RNA)中的全部遗传信息，也即是一个生物体中完整的染色体DNA序列。顾名思义，微生物的基因组，即是指微生物染色体中的所有DNA序列。基因组学，也即是研究基因组构成的一门学科，它兴起于上世纪90年代初的人类基因组计划。在人类基因组计划实施的同时，人们也启动了微生物的基因组研究计划。1995年，Fleischmann研究小组率先发布了第一株微生物的全基因图谱。他们采用全基因组随机测序法(即wholegenome shotgun sequencing，简称“鸟枪测序法”)，对流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)的全基因组进行了较为全面的分析，获得了第一株微生物的全基因组数据，这在细菌基因组测序的历史上属首次[1]。此后，随着测序技术的发展，越来越多的临床微生物(或者称为病原微生物)、模式微生物、环境微生物、工业微生物等都被测序，并获得全基因组数据[2-7]。近年来，完成的基因组(包括微生物基因组在内)呈现几何级数增长，这不仅为探索基因本质提供了大量的数据，也为后基因组时代的到来奠定了坚实的基础。

    2 基因组测序技术的研究进展

    Sanger测序是最早的基因测序技术，被称为第一代测序技术，它是由Fredrick Sanger在1975年发明的。该测序方法又称为“双脱氧链终止法”[8]。其基本原理是在聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)的过程中，不断地在引物的3’端加入dNTP ......