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编号:1451825
江西省水痘-带状疱疹病毒基因特征研究
http://www.100md.com 2017年3月13日 实验与检验医学 2017年第1期
基因型,1材料与方法,2结果,3讨论
     周 珺,熊 英,龚 甜,李健雄

    (江西省疾病预防控制中心,江西南昌330029)

    江西省水痘-带状疱疹病毒基因特征研究

    周 珺,熊 英,龚 甜,李健雄

    (江西省疾病预防控制中心,江西南昌330029)

    目的了解江西省2010至2013年流行的水痘-带状疱疹病毒的基因型别。方法选取2010年至2013年南昌市的水痘-带状疱疹临床诊断病例,采集疱疹液和(或)咽拭子标本,提取水痘病毒DNA,对病毒基因组的ORF22区及ORF68区进行扩增、测序和分析,将测序结果与GeneBank的VZV参考株的基因序列进行比较。结果采集到的84份标本中共有55份检测到水痘-带状疱疹病毒核酸;ORF22区的测序结果经与水痘带状疱疹病毒J基因型的代表株p-Oka株及水痘疫苗代表株v-Oka株的基因序列进行对比,发现6个关键位点完全相同;对ORF68区的测序结果进行比对并未发现任何突变。结论江西省2010-2013年流行性的水痘-带状疱疹病毒均为J基因型。

    水痘-带状疱疹病毒(VZV);测序;基因型

    水痘-带状疱疹病毒(Varicella-Zoster Virus,VZV)是引起常见疾病水痘及带状疱疹的病原体,初次感染人体可引起水痘,而后可以长期潜伏在人体内,当机体免疫力下降时,病毒会再度感染人体,形成带状疱疹。此外,水痘是一种常见的儿童呼吸道传染病,每年在全世界引起大量的儿童发病。

    VZV是一种DNA病毒,全基因组共12.5万个碱基,71个开放读码框(Open Reading Frame,ORF),编码80个蛋白质。VZV只有一个血清型[1],但不同毒株之间在基因序列上存在差异。近年来从基因水平上来探讨不同VZV毒株之间的差异并通过基因序列分析来对病毒进行分型成为国际上VZV研究的热点[2]。本研究将选取水痘-带状疱疹病毒基因组中的ORF22及ORF68区进行基因扩增及序列分析,通过与水痘-带状疱疹病毒的几种基因型代表株对应区域的序列进行比对,确定我省近几年流行的水痘-带状疱疹的主要基因型。

    1 材料与方法

    1.1 标本来源从2010年至2013年,在江西省儿童医院及南昌市高新区医院选择临床诊断为水痘或带状疱疹的病人采集疱疹液和(或)咽拭子标本,共84份,所有标本采集后均置于-70℃冷冻保存。

    1.2 实验方法

    1.2.1 主要试剂与仪器主要试剂:DNA提取试剂盒QIAmp DNA Mini kit(德国Qiagen公司,51306),DNA扩增试剂盒GoTaq Green Master Mix (Promega公司 ......

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