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编号:1451405
四引物法快速检测白细胞介素1A基因3'UTR插入/缺失多态性
http://www.100md.com 2018年4月25日 实验与检验医学 2018年第2期
凝胶电泳,琼脂糖,1对象与方法,2结果,3讨论
     贾二娟 ,吴梦怡 ,柴丽娜 ,余乐涵 ,万福生 ,朱伟锋

    (1、许昌市中心医院检验科,河南 许昌 461000;2、南昌大学医学部第一临床医学院,江西 南昌 330006;3、南昌大学医学实验教学部,江西 南昌330006;4、南昌大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,江西 南昌 330006)

    作为IL-1家族的一个重要成员,白细胞介素1A(interleukin-1A,IL-1A)在免疫调节和炎症反应中都发挥着十分重要的作用。位于IL-1A基因3'非翻译区(untranslated region,UTR)的“TTCA”四碱基插入/缺失 (insertion/deletion,Ins/Del) 多态性(rs3783553) 可影响 IL-1A mRNA 和蛋白表达[1,2],从而可能与肝癌[1]、鼻咽癌[2]、口咽癌[3]、胃癌[4]、前列腺癌[5]、卵巢上皮癌[6]、子宫内膜癌[7]、宫颈癌[8]、脑胶质瘤[9]、斑秃[10]、骨关节炎[11]等的发病相关。目前该位点的检测方法中,有的操作较复杂,有的成本较高,所需时间较长,因此有必要建立一种快速、简便、低成本的rs3783553检测方法。

    四引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应 (tetra-primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction,T-ARMS-PCR) 是在等位基因特异性PCR基础上建立起来的一种单核苷酸 多 态 性 (single nucleotide polymorphisms,SNPs)分型方法[12]。T-ARMS-PCR对SNPs的分型只需要四条普通引物,PCR扩增后直接进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳时条带出现的位置即可判断基因型,已被广泛用于SNPs和突变的研究[13-16]。目前还没有T-ARMS-PCR法对rs3783553检测的报道。因此,如果针对rs3783553设计四条引物,可能会实现该多态性位点的快速、简便、低成本检测。

    1 对象与方法

    1.1 研究对象 100例血样由在许昌市中心医院体检的100名志愿者(均知情同意,其中男性59名,年龄27~65岁,女性41名,年龄27~70岁)提供。每位志愿者抽取静脉血2ml,EDTA抗凝。

    1.2 方法

    1.2.1 基因组DNA提取 使用天根全血DNA提取试剂盒提取全血基因组DNA[17] ......

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