扬州市乙型肝炎病毒B基因型前S基因特征分析
B型,1材料与方法,2结果,3讨论
肖越胜 ,张军 ,唐阳 ,杨立坤 ,张晋(1、扬州市医学检验中心,江苏 扬州 225001;2、扬州市疾病预防控制中心,江苏 扬州 225001)
人乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)属嗜肝DNA病毒科,基因组是不完全闭合环状双链DNA,长度约3.2kb,有四个部分重叠的开放式阅读框(ORF),前 S/S 区(PreS/S)、PreC/C、Pol、X。 其中PreS/S区编码大、中、小3种包膜蛋白。HBV序列异质性是一个特征,源于其较高的病毒复制产量及突变率,该突变是由于在逆转录过程中缺乏校对的酶而造成的。长期的自发性突变使基因序列产生差异,依据HBV DNA全序列的核苷酸差异,共分 A-I九个基因型[1,2]。HBV 基因型中存在混合感染的现象和明显的地域分布,我国HBV感染以 B和 C型为主,占 90%以上[3,4],南方以 B和 C型为主,A型和D型在我国东部地区有少量存在。HBV在复制过程中催化逆转录过程的酶缺乏3’-5’核酸外切酶活性,从而缺乏校正功能,不能修正在外界选择压力改变下C、S区等产生的变异,使其抗原性减弱,产生免疫逃逸现象。目前有关HBV S区基因变异与乙肝疫苗免疫失败、肝移植乙肝免疫球蛋白逃逸、隐匿性HBV感染等方面的研究较多[5,6]。扬州市HBV感染以基因B、C型为主[7],但在感染过程中病毒的前S基因变异和特征目前未有报道。
1 材料与方法
1.1 样本来源 样本采自本中心门诊,静脉采血,3000rpm离心,取血清进行乙型肝炎病毒核酸(HBV-DNA)荧光PCR检测 ......
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