邹淑慧，李金亮，廖莎莎，张丽琴，刘聪

    (赣州市人民医院检验科，江西 赣州 341000)

    至2015年5月以来，寨卡病毒 (Zika Virus，ZIKV)在美洲区域的传播不断升级，疫情逐步恶化，甚至有城市化和全球化传播趋势，对国际公共卫生造成严重威胁[1]。2016年2月，我国出现首例输入性寨卡病毒感染，随后国内陆续出现多例ZIKV感染病例，引起我国政府和卫生部门的广泛关注[2]。

    寨卡病毒属黄病毒属，为单股正链RNA，长约11kb，分为亚洲型和非洲型[3]，在系统发生树上与同为黄病毒属的登革热病毒、Spondweni病毒、日本脑炎病毒、西尼罗病毒非常相近[4]。寨卡病毒基因编码多聚蛋白，包括病毒衣壳蛋白C，膜前体蛋白PrM，包膜蛋白 E和7个非结构蛋白(NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B、NS5)。 E 蛋白是病毒表面的主要蛋白，参与调节结合以及膜融合等方面。非结构蛋白中的NS5是病毒中最大的蛋白，含有RNA-依赖RNA聚合酶和甲基转移酶，负责病毒基因组RNA的合成及加帽[5,6]。本研究将从生物信息的角度分析ZIKV E蛋白和 NS5蛋白序列特征，为进一步挖掘其基因信息，研究其致病机制提供分子依据，从而预防和控制寨卡病毒的感染与流行。

    1 材料和方法

    1.1 序列来源 所有病毒株E和NS5核苷酸、氨基酸序列均来源于GenBank中已登记的黄病毒属相关参考序列。

    1.2 ZIKV E、NS5核苷酸与氨基酸同源性比较 用Clustal X和Bioedit软件对ZIKV不同地理株系及同属成员的E、NS5基因及编码蛋白序列进行比对，计算核苷酸与氨基酸同源性。

    1.3 ZIKV E、NS5蛋白二级结构分析 选取中国首例分离的ZIKV基因组序列(登陆号：KU744693.1)为研究对象[2]，获取E、NS5基因及氨基酸序列。通过蛋白结构在线预测网站Predict Protein Server(https：//www.predictprotein.org/)分析 E、NS5 蛋白的二级结构 ......