免提取冻干式百日咳鲍特菌核酸检测方法建立及应用
定量,1材料与方法,2结果,3讨论
郭鹏波,章波,王彦红,高利飞(1.郑州儿童医院 儿科医学研究所,河南 郑州 450000;2.安图生物,河南 郑州 450000)
百日咳是由百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis)侵入人体呼吸道而引起的急性呼吸道传染病[1]。主要特征是阵发性痉挛性咳嗽,且咳嗽时间为2~3个月,故名"百日咳"[2]。百日咳是由革兰阴性杆菌引起的高度传染性呼吸道疾病[3]。尽管疫苗覆盖率很高,但近日百咳仍在复苏[4],且对人类健康产生巨大威胁[5]。由于百日咳鲍特菌毒性区和致病因子比较复杂,在最近的10~20年内,全球百日咳患病人数有明显的上升趋势[6],且在我国陕西、天津和新疆等地百日咳患者也有增加的趋势[7-9]。由于中国的百日咳发病率呈现逐年递增的趋势,如何在发病早期快速诊断和检验出百日咳鲍特菌,已经成为当前的热点。目前已经报道的有细菌培养、酶联免疫检测法、核酸检测法等多种方法,核酸检测法虽然敏感度最高[10],但操作技术要求高,限制了本方法的临床应用。本文对百日咳的荧光定量实验室诊断方法进行改进优化,建立了快速的便携式百日咳鲍特菌核酸检测方法。
1 材料与方法
1.1 试验材料 临床样本来自郑州儿童医院,百日咳鲍特菌DNA 来源于河南CDC,细菌基因组DNA提取试剂盒购于凯杰生物公司,PCR 产物纯化及质粒DNA 抽提试剂盒购自TaKaRa 公司,2×Taq PCR MasterMix(KT201)购自北京天根生化技术有限公司,引物合成和测序由上海生工生物有限公司、抗干扰Taq 酶购自百奥莱博。主要仪器有Thermo Nano-Drop 2000c 超微量紫外分光光度计、Biometra TT100PCR 仪、博医康Pilot5-8S 冷冻干燥机及安捷伦荧光定量PCR 仪。
1.2 质粒标准品的制备 以百日咳鲍特菌DNA 为模板 ......
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