EB病毒潜伏膜蛋白2的抗原表位预测及其与HLA等位基因的相关性分析
频率,1材料和方法,2结果,2讨论
邹淑慧,黄薇,刘聪,邹翠翠,廖莎莎,张丽琴(1.赣州市人民医院检验科,江西 赣州 341000;2.赣州市章贡区东外社区卫生服务中心,江西 赣州 341000)
EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种人类疱疹病毒,与Burkitt’s淋巴瘤、胃癌以及鼻咽癌等肿瘤的发生密切相关[1]。有报道[2-3]称在鼻咽癌等恶性肿瘤组织中EBV能持续表达EBNA1、LMP1、LMP2等蛋白,可作为体内特异性CTL杀伤肿瘤细胞的靶分子。其中LMP2蛋白比较保守,含有HLA限制性CTL表位,诱导机体产生特异的T细胞反应,并且不具有细胞转化作用。因此,LMP2是研究抗EBV肿瘤疫苗的理想靶抗原。本研究将利用生物信息软件和网络相关数据库分析不同地理株系的EB病毒LMP2氨基酸序列的同源性,预测与之相关的B细胞和T细胞抗原表位,为EB病毒疫苗的设计和制备奠定基础。
HLA是人类主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)基因编码的产物,为人类主要的遗传标志。种族的和地区差异可导致其分布的不一致,因此具有高度多态性,而这多态性的差异决定了HLA在个体免疫中的应答能力以及对疾病的易感性都有所不同。此外,研究发现HLA分子可通过与外源性抗原结合,进而诱发CD4+T辅助细胞的免疫应答,并在免疫识别及清除病毒感染过程中发挥着关键性作用[4]。本研究将预测与EB病毒LMP2蛋白结合力较强的HLA等位基因,并通过数据库及文献验证推导出EB病毒的易感人群和可能发生流行的地区,为采取积极有效的防控措施提供依据。
1 材料和方法
1.1 EBV LMP2氨基酸序列的同源性比较 从GenBank中获得来自不同国家地区的EBV LMP2氨基酸序列 ......
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