基于网络药理学和生物信息学的结肠炎奇效颗粒治疗溃疡性结肠炎作用机制研究
介素,靶标,1材料与方法,1活性成分的筛选,2活性成分靶点预测,3UC疾病靶点预测,4“药物-疾病-靶点”网络的构建,5核心靶点的筛选,6GO生物功能和KEGG代谢通路富集分析,2结果,1
孙钰婧 霍志鹏 王 玉 李瑞明 秦民坚 何 毅▲1.天士力控股集团有限公司 天士力研究院/创新中药关键技术国家级重点实验室,天津 300410;2.中国药科大学中药学院,江苏南京 210009
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种结肠和直肠慢性非特异性炎性肠病,以结肠黏膜连续性、弥漫性炎症为主要特点,病程漫长,以血性腹泻、腹痛等为主要临床表现,长期严重可并发消化道穿孔和结肠癌[1],严重影响了患者的生活质量和心理状况,目前认为UC 的发生以遗传因素为基础,在心理及环境因素的持续诱发下,肠道黏膜屏障受损,肠内菌群失调,导致免疫功能紊乱[2],但具体病因尚不十分明确。临床上,西医治疗以口服氨基水杨酸类药物、糖皮质激素、免疫抑制剂等为主,配合全身支持治疗,重症患者考虑手术治疗[3-4];中医治疗常口服复方中药或有效成分,采用中药灌肠、针灸等不同形式的疗法[3],多层次综合作用于患者及患处。结肠炎奇效颗粒是课题组开发的中药六类新药,由骨碎补、生车前子等6 味中药组成,具有温肾暖脾、化瘀导滞之功效,用于慢性非特异性UC 的治疗[5],目前处于Ⅱ期临床阶段。前期研究表明,结肠炎奇效颗粒能够明显减轻冰醋酸、葡聚糖硫酸钠和三硝基苯磺酸所致的UC 小鼠、大鼠结肠炎症和溃疡病变程度[6],但结肠炎奇效颗粒的药效物质基础和作用机制尚不明确。
研究采用网络药理学和生物信息学方法,通过构建“药物-疾病-靶点”网络从整体角度分析结肠炎奇效颗粒治疗UC 的作用机制,预测该方治疗UC 的关键靶基因,并对其进行生物功能和代谢通路分析,旨在初步认识该方治疗UC 的作用机制,为进一步的实验验证提供依据。
1 材料与方法
1.1 活性成分的筛选
在中药系统药理学分析平台(pharmacology analysis platform of traditional Chinese medicine system,TCMSP)数据库、化学专业数据库及参考文献中搜集各药材化学成分,结合前期质谱鉴定结果,初步获取化学成分,并在TCMSP 和SwissADME 数据库中筛选出口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%且类药性(drug-like,DL)≥0.18 的化学成分作为潜在活性成分。
1.2 活性成分靶点预测
将活性成分导入TCMSP 和化学专业数据库中查询作用靶点,利用Uniprot 数据库将靶点名称校正为官方名称(Official Symbol) ......
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