基于网络药理学分析绞股蓝治疗骨质疏松症的机制研究
成骨细胞,靶点,1方法,1获取及筛选有效活性成分及其靶点,2OP作用靶点获取,3绞股蓝有效活性成分作用靶点与疾病靶点交集的获取及构建网络关系图,4共同靶点的获取和蛋白相互作用网络的构建,5GO功能富集分析和KE
甄瑞峰 卢文君 刘树娇桂林医学院附属医院全科医疗科,广西桂林 541001
骨质疏松症(osteoporosis,OP)是一种骨量低、骨组织微结构损坏,骨脆性增加,易发生骨折的全身性骨病。有调查报告显示,我国OP 的患病率在50 岁以上人群为19.2%,其中男性为6.0%,女性为32.1%;65岁以上人群达到了32.0%,其中男性为10.7%,女性为51.6%。OP 发病形势严峻,给社会、家庭带来了沉重的负担。
近年来,有众多学者研究传统医药治疗OP 的疗效,进一步证明了中医在OP 治疗过程中的积极作用。绞股蓝[Gynostemma pentaphyllum (Thunb.)Makino.]别名七叶胆、百味莲,属于葫芦科、绞股蓝属草质攀援植物,以根状茎入药,有消炎退肿、活血祛风、降压等功效。在中国、日本、朝鲜、东南亚等多地均有分布。绞股蓝中含有类黄酮、皂苷、无机元素等,其提取物在治疗动脉粥样硬化、抑制肿瘤生长、抗抑郁方面有一定的疗效。而近年的多项动物实验证实,绞股蓝的提取物在促进成骨细胞增殖、分化方面有一定的作用。本研究运用网络药理学的研究方法,探讨绞股蓝治疗OP 的潜在有效成分及相关机制,为OP 的治疗提供理论依据。
1 方法
1.1 获取及筛选有效活性成分及其靶点
以“绞股蓝”为关键词,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems phar macology Database and Analysis Platform,TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)进行检索,获得其化学成分,并以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,类药性指数(drug like index,DL)≥0.18 为标准设定筛选条件。
使用Perl 软件,对TCMSP 获取的绞股蓝所有成分所对应的靶点进行筛选,获得绞股蓝有效活性成分所对应的作用靶点。将有效活性成分对应的作用靶点利用UniProt(https//www.uniprot.org/)进行标准化处理,限定物种设定为“human(人)”,得到绞股蓝有效活性成分的潜在靶点,将重复靶点和非标准靶点剔除,获取有效活性成分所匹配的靶点库。使用网络可视化软件Cytoscape3.8.2 构建有效活性成分-靶点网络。
1.2 OP 作用靶点获取
将“Osteoporosis”作为关键词输入Genecards(https://www.genecards.org/)、 药物靶标数据库(Therapeutic Target Database ......
您现在查看是摘要页,全文长 10412 字符。