人肾细胞生长分化过程中miRNA表达量的变化分析(2)
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值得注意的是,miR-16在两组实验里都有显著表达量的改变。miR-16在肾癌细胞分化过程中表达量显著下降,但在人胚肾细胞HEK293生长过程中则表达量大幅上调,显示miR-16在肾细胞生长周期中起到了关键的作用。
临床上肾细胞癌对化疗和放疗均不敏感,现有治疗手段有限,早发现对于治疗及预后有重要意义。本研究通过检测miRNA在人胚肾细胞和人肾细胞癌细胞系中的表达谱变化,明确有意义的特定miRNA的序列,既有助于肾细胞癌早期检测,也为深入研究肾细胞癌的发生机制奠定一定基础。
深度测序技术是最新测序技术之一,能提供文库中分子序列及拷贝数等详细信息。小分子RNA深度测序技术有其精确的测序和拷贝读数的优势,不仅能精确定量已知miRNA的拷贝数,而且能发现新的小分子RNA和新的miRNA;而以往的miRNA的微阵列芯片(miRNA microarray)则只能提供已知miRNA的相对表达量,不仅存在假阳性现象,且不能发现新的miRNA。因此,小分子RNA测序能弥补miRNA microarray的相应不足,逐渐成为主要的miRNA研究工具之一。本研究以人肾细胞癌分化细胞系HRC-DH1与人胚肾细胞细胞系HEK293为研究对象,精确地提供了肾细胞在分化与生长过程中特定miRNA表达变化信息,可以为相关研究提供直接的数据支持。
除了在结果中所示的miR-21等miRNA可能参与肾癌细胞分化过程,miR-142可能参与人胚肾细胞生长过程外,笔者特别留意到miR-16在肾细胞不同生长分化状态表达量呈现规律性变化。miR-16是人类细胞中非常重要的一种miRNA,发现较早,在不同生理病理条件下在不同细胞状态中表现出不同的功能,如在乳腺癌中,miR-16能下调抑癌基因表达,有助于乳腺癌的发生[6];miR-16亦可加强人类骨髓间质干细胞的分化[7]。本研究数据显示,miR-16可能在肾细胞癌分化过程和胚肾细胞生长过程中起到了关键作用,其调控机制需进一步研究。
参考文献
[1] Barte D P.Micro RNAs:genomics,biogenesis, mechanism,and function[J]. Cell,2004,116(2):281-297.
[2] 张畅,宁勇.MicroRNA与恶性肿瘤[J].中外医学研究,2012,10(1):159-160.
[3] Maher E R.Genomics and epigenomics of renal cell carcinoma[J].Semin Cancer Biol,2012,52(10):1.
[4] Li Y,Zhang Z,Liu F,et al.Performance comparison and evaluation of software tools for microRNA deep-sequencing data analysis[J].Nucleic Acids Res,2012,40(10):4298-4305 ......
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