临床上，笔者发现部分患者症状持续存在，可能是由于针对C.t热休克蛋白表位出现了自身免疫病理反应，局部组织慢性炎症反应和纤维化而出现前列腺炎、附睾炎、子宫内膜炎、附件炎、盆腔炎等并发症[17]，治疗失败患者首次传代培养未见包涵体，但热休克蛋白60含量增加，也提示C.t可能处于一个持续感染状态[18]，加之患者精神紧张，部分患者出现心理问题而自诉临床症状持续存在；沙眼衣原体感染后患者的自觉症状与患者的血清型、性别、年龄等各种因素有关；临床上症状持续但无再感染的患者，而荧光PCR检测阴性，也可能合并其他原因导致的泌尿生殖道感染性疾病，如患者衣原体感染的慢性尿道炎癥状与慢性前列腺炎的症状可能类似，或者患者感染了其他病原体(如支原体、生殖器疱疹等)，应对患者对可能的其他病原体行详细多次的检测，排除其他感染性疾病的可能性，避免误诊[19]，因此，单采用临床症状消退与否来判定泌尿生殖道C.t感染是否治愈该标准不够客观，荧光PCR检测具有高度的敏感性和特异性，其出现假阳性概率小，可推荐其作为患者治疗后随访的重要检测手段。

    邵丽丽等[20]发现在924例泌尿生殖道C.t感染中，临床学判愈率显著高于第1、2、3次病原学判愈率且第1次病原学判愈率显著高于第2次；第2次与第3次比较 ......