基于网络药理学和分子对接探讨癫痫宁片治疗癫痫的潜在作用机制研究
钩藤,靶点,1方法和方法,1癫痫宁片中药活性成分筛选,靶点预测,2癫痫相关靶点的获取,3药物–疾病靶点预测结果,4靶蛋白相互作用及核心靶点筛选,5基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全
闫文浩,李晨豪,李尚颖,左莉华,李泽运*1.郑州大学第一附属医院,河南 郑州 450052
2.辽宁省药品检验检测院,辽宁 沈阳 110036
癫痫是一种由于大脑神经元异常同步化放电引起的长期、慢性、反复、多病因、多临床表现的神经系统疾病[1]。其病因复杂,危害巨大,可造成不可逆的脑功能障碍甚至死亡。目前癫痫临床治疗主要包括化学药物治疗、中药治疗、生酮饮食、神经调控、外科手术治疗等,其中化学药物治疗依赖卡马西平、丙戊酸钠等抗癫痫药物,可能导致维生素D 水平降低、肝肾损伤等风险[2]。中医药治疗为癫痫控制提供了安全有效的补充手段[3]。癫痫宁片是由石菖蒲、缬草、蜘蛛香、钩藤、甘松、薄荷脑、牵牛子、千金子组成,具芳香之气,行散之力较强,为宣气通窍之佳品,既能芳香化湿、醒脾健胃,又可化浊祛痰、涤痰开窍之药,具有化痰开窍、化湿和胃、醒神益智、理气活血、散风祛湿等功效[4]。近年来,癫痫宁片已被广泛应用于原发性、继发性癫痫治疗中,常与化学药物协同发挥作用,扬长避短,增强疗效[5]。然而,由于成分复杂,其作用机制至今仍不明确,有待进一步研究。
随着系统生物学的发展,药物成分、靶点、通路的复杂多层次可被现代研究手段所识别展现,为中医药现代药理研究提供了强有力的工具。网络药理学与分子对接相结合的研究方法则逐渐系统化,广泛应用于中药复杂作用机制的探索[6]。网络药理学通过公共数据库搜集或化学鉴别等手段,明确中药的化学物质基础、与疾病相对应的潜在靶点、可能形成的代谢通路等依次展开复方中药的多成分、多靶点、多通路生物学特征[7];分子对接技术则对网络药理学研究揭示的核心靶点、核心成分进行亲和力评估,进而验证网络药理学研究的结果的准确性[8]。二者相结合产生了重要影响,成为中药复杂作用机制研究的系统策略。
本研究以癫痫宁片为研究对象,基于网络药理学方法,初步探讨癫痫宁片治疗癫痫的作用机制,构建了药物的活性成分、靶点与癫痫相关疾病基因之间的相互作用网络,并进行分子生物学补充验证。本研究契合中医理论系统性、整体性的研究理念,为癫痫宁片治疗癫痫的临床合理应用和进一步科学研究提供了理论依据。
1 方法和方法
1.1 癫痫宁片中药活性成分筛选、靶点预测
通过TCMSP(https://tcmspw.com/tcmsp.php)数据库对钩藤、石菖蒲、千金子进行活性成分的收集。在TCMSP 中的“herb name”输入中药名称,以化合物口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18 作为筛选条件 ......
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