基于网络药理学和分子对接研究黄芩治疗白癜风的作用机制
靶点,1材料与方法,1黄芩活性成分及其作用靶点的获得,2白癜风相关靶点的获得,3黄芩-白癜风交集靶点获取,4黄芩-活性成分-白癜风靶点网络的构建及主要活性成分的获取,5黄芩-白癜风交集靶点蛋白互作(PPI)
刘浩,杨洪柳,柳志诚,王文琪,梁敬臣,刘永刚*1.北京中医药大学,北京 100029
2.北京三和丽生物科技有限公司,北京 100068
白癜风是一种由黑素细胞数量减少或功能丧失导致的获得性色素脱失性皮肤病[1-2],影响全球0.1%~2.0%的人口[3]。临床表现为面部、颈部、手部等部位出现白色斑块[4],导致患者产生容貌焦虑,严重影响患者的心理健康以及生活质量[5]。目前,白癜风未有明确的发病机制,可能与神经、自身免疫、黑色素细胞失常等因素有关[6-8]。中医学认为,白癜风是由风邪相搏于皮肤,导致气血失和所引起[9-10]。
黄芩为唇形科植物黄芩ScutellariabaicalensisGeorgi 的干燥根[11]。研究表明,黄芩中主要含有黄芩苷、黄芩素等黄酮类化合物,具有抗氧化活性、抗病原微生物、调节机体免疫力、激活酪氨酸酶活性等多种药理作用,对于白癜风的治疗也有较好的疗效[12-16]。但相关文献未系统分析其物质基础以及作用机制[17]。故此,本研究应用网络药理学的相关方法,系统分析黄芩治疗白癜风的主要活性成分、核心靶点以及通路,以期为黄芩治疗白癜风的临床应用提供参考。
1 材料与方法
1.1 黄芩活性成分及其作用靶点的获得
使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php/),以化合物的口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18 为筛选条件[7],检索得到黄芩中的活性成分及其作用靶点,使用Uniprot 数据库(http://www.Uniprot.org/)对作用靶点进行基因名转化。通过SwissTargetPrediction 数据库(http://www.swisstarget prediction.ch/)检索得到各个活性成分的作用靶点进行补充。合并2 个数据库检索得到的作用靶点,删除重复值,即为黄芩中活性成分的作用靶点。
1.2 白癜风相关靶点的获得
通过OMIM 数据库(https://www.omim.org)和GeneCards 数据库(https://www.genecards.org/)检索白癜风的相关靶点,以关键词“vitiligo”进行检索,获得2 组白癜风的潜在作用靶点。合并检索结果后删除重复值,即白癜风相关靶点。
1.3 黄芩-白癜风交集靶点获取
将黄芩中活性成分的靶点和白癜风的靶点导入微生信数据分析平台(http://www.bioinformatics.com.cn)制作Venn 图 ......
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