基于网络药理学和实验验证探讨大蒜抗幽门螺杆菌感染的作用机制
烯丙基,硫醚,1资料与方法,1网络药理学方法,2体外抑菌实验,2结果,1大蒜活性成分收集,2大蒜治疗Hp感染的潜在靶点,3潜在靶点PPI网络图,4GO和KEGG通路富集结果,5分子对接分析结果,6体外
何银,陈红梅,陈晨,潘艳丽,米雪,胡志林*1.石河子大学 药学院,新疆植物药资源利用教育部重点实验室,新疆 石河子 832003
2.新疆华世丹药业有限公司,新疆 乌鲁木齐 830001
幽门螺杆菌(Hp)是一种微需氧革兰阴性杆菌,主要定植于胃和十二指肠。Hp 在人群中主要通过口-口途径传播,目前全球Hp 感染率已超过50%,我国自然人群Hp 感染率在59%[1-2]。Hp 感染与多种人类上消化道疾病有关,感染的患者一般患有慢性活动性胃炎,其中10%~20%可发展为消化性溃疡,50%可发展为胃黏膜萎缩,1%~3%甚至可发展为胃癌或胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤[3-4]。随着Hp治疗的广泛开展,根除率逐渐降低,有效治疗Hp 感染面临着挑战,Hp 耐药性是导致幽门螺杆菌根除率越来越低的主要原因[5]。根除Hp 是消除慢性胃炎、预防和治愈消化性溃疡、有效治疗MALT 淋巴瘤、降低胃癌发病率最经济、有效的方法[6]。
大蒜是亚洲种植最广泛的蔬菜作物之一,也是世界闻名的药用植物。大蒜中至少含有33 种硫化物,硫化物是使大蒜产生刺激性气味、发挥药理作用的主要成分[7-9]。大蒜素是大蒜中的主要生物活性成分,具有抗癌、抗炎、抗氧化、免疫调节、抗血小板聚集、心肌保护、心血管保护、消化系统保护等生物学功能[10-13]。大蒜素具有较强的抗菌活性,抑制Hp 的生长,有效预防和减少Hp 的感染,还在临床上对系统性真菌和细菌感染有良好的治疗效果[14-16]。本研究将基于网络药理学、分子对接和体外抑菌试验研究大蒜治疗Hp 感染可能的活性成分、靶点和通路,探讨其作用机制,为后续研究提供参考。
1 资料与方法
1.1 网络药理学方法
1.1.1 药物活性成分靶点的收集 在HERB数据库检索“大蒜”并下载相关成分表,并通过相对分子质量(MW)≤500,脂水分配系数(xlogp)≤5,氢键给体数目(H-bond donors)≤5,氢键受体数目(Hbond acceptors)≤10 筛选其活性成分,再通过PharmMapper、Swiss Target Prediction、BATMANTCM 数据库(Score cutoff≥20,P<0.05)收集大蒜活性成分相关靶点。利用Cytoscape 3.9.1 软件制作“药物-成分-潜在靶点”网络图。
1.1.2 疾病靶点收集 以“Helicobacterpyloriinfection”作为关键词,在GeneCards(Relevance score≥5)、OMIM、DRUGBANK、DisGeNET 数据库进行检索 ......
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