基于网络药理学与分子对接技术探讨齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎的作用机制
靶点,1资料与方法,1齿痛消炎灵颗粒有效成分与靶点的收集,2牙周炎相关靶点的获取,3“中药–活性成分–靶点”网络及“化合物–靶点–疾病”网络的构建,4蛋白相互作用(PPI)网络的构建,5GO分
张婉婉,张子建,张旭,张洁茹,王伟然,王春英,1.河北医科大学 药学院 药物分析教研室,河北 石家庄 050017
2.河北省中医院 口腔科,河北 石家庄 050011
3.新疆科技学院 医学院,新疆 库尔勒 841000
牙周炎是一种慢性多因素炎症性疾病,与牙菌斑的堆积有关,其特征是牙齿支持器官的进行性破坏,包括对牙周韧带和牙槽骨的破坏[1],其临床表现主要为牙龈炎症、牙槽骨吸收、牙周袋形成及牙齿松动[2]。作为全世界第6 大最流行的疾病,严重的牙周炎影响着大约10%的人口,牙周炎还被证实与心血管疾病、高血压、糖尿病、癌症和炎症性疾病在内的全身性疾病等多种系统性疾病的风险增加有关[3]。因此,其预防与治疗工作非常重要。
齿痛消炎灵颗粒由防风、牡丹皮、青皮、荆芥、青黛、地黄、白芷、甘草、细辛、石膏组成,具有疏风清热,凉血止痛的功效。用于脾胃积热、风热上攻所致头痛身热、口干口臭、便秘燥结、牙龈肿痛;急性齿根尖周炎、智齿冠周炎、急性牙龈(周)炎、急性牙髓炎见上述证候者[4]。临床上多与其他药物联合治疗牙周炎,且疗效确切,安全性好[5-7]。
随着生物信息学的快速发展,新兴的网络药理学以大数据库为基础,已成为从分子水平到途径水平详细描述复杂药物系统作用机制的有用工具[8]。网络药理学契合了中医整体哲学的核心思想,作为一种最先进的技术,该方法将研究范式从目前的一靶一药模式更新为新的“网络靶向多组分”模式。它通过提供详细的化合物-靶点和靶点-通路网络,有助于评价中药的合理性和配伍。本研究拟从网络药理学的角度出发,预测齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎的药效成分和潜在靶点,并通过基因本体(GO)功能分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析得到与齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎相关的信号通路和代谢途径,再通过分子对接技术验证活性成分与核心靶点的结合能力。为深入研究齿痛消炎灵颗粒的作用机制及药效物质基础提供了一定的理论依据。
1 资料与方法
1.1 齿痛消炎灵颗粒有效成分与靶点的收集
利用中药系统药理学数据库[9](TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)平台检索齿痛消炎灵颗粒中防风、牡丹皮、青皮、荆芥、甘草、青黛、白芷、细辛、地黄、石膏10 味中药的成分,由于地黄在TCMSP 中检索不到,故利用ETCM 数据库[10](https//www.tcmip.cn/ETCM/index.php/Home/Index/)进行补充 ......
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