基于网络药理学与分子对接探讨小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的作用机制
网络图,靶点,1材料与方法,1数据库信息,2筛选药物及疾病靶点,3构建“药物-活性成分-靶点”网络图,4构建蛋白互作(PPI)网络图,5基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KE
刘娇,周蓓,易蔚,陈明惠广西中医药大学,广西 南宁 530200
从过去的100 年至今,全世界暴发了多次全球性的流感大流行[1]。全人群对流感普遍易感,而儿童在流感季节是重点关注群体[2],在每年流行季节儿童罹患率为20%~30%,特定地区的儿童流感罹患率可达到50%左右[3]。甲型流感是春季易流行的常见流感病毒,且甲型流感病毒易变异,流感疫苗预防接种不能有效预防变异毒株的感染[4],西医针对甲型流感常用神经氨酸酶抑制剂奥司他韦作为首选用药[5],但存在甲型流感病毒耐药的风险,小儿豉翘清热颗粒治疗儿童甲型流感有显著效果[6],且在流行性感冒诊疗方案、儿童流感中西医结合等专家共识中作为推荐用药[7-8]。临床报道发现联用小儿豉翘清热颗粒比单用奥司他韦在使症状改善、加快病毒转阴等方面,具有明显疗效[9]。网络药理学是基于疾病-靶点-药物的多层网络结构,从系统角度预测药物靶点,实现了传统药物与现代科学的接轨,是中医药领域的研究热点[10-11]。使中医现代化具有潜在的发展前景。分子对接是研究配体和受体相互作用,并预测其结合模式和亲合力的一种理论模拟方法[12],为新型药物的研发提供了一个较好的工具[13]。因此,本研究借助网络药理学和分子对接技术,分析小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的作用机制,为后续研究提供理论支持。
1 材料与方法
1.1 数据库信息
UniProt 数据库(https://www.uniprot.org);中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库(https://old.tcmspe.com/tcmsp.php);GeneCars 数据库(https://www.genecards.org);OMIM 数据库(https://omim.org);TTD 数据库(https://db.idrblab.net/ttd);PharmGkb 数据库(https://www.pharmgkb.org);STRING 数据库(https://cn.string-db.org);DAVID 数据库(https://david.ncifcrf.gov);微生信官网(https://www.bioinformatics.com.cn)。
1.2 筛选药物及疾病靶点
小儿豉翘清热颗粒药物组成有连翘、淡豆豉、薄荷、荆芥、炒栀子、大黄、青蒿、赤芍、槟榔、厚朴、黄芩、半夏、柴胡、甘草,运用中草药系统药理学平台TCMSP 数据库筛选药物活性成分 ......
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