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编号:476159
基于网络药理学与分子对接技术探讨大黄肝毒性的作用机制
http://www.100md.com 2023年12月27日 现代药物与临床 2023年第12期
网络图,黄素,靶点,1材料与方法,1大黄活性成分和潜在肝毒性成分的筛选,2大黄活性及潜在肝毒性成分作用靶点的预测,3人类肝毒性相关靶点的获取,4预测大黄肝毒性潜在作用靶点,5“大黄成分–肝毒性作用靶点”网络
     黄巧波,刘明平

    广州中医药大学 中药学教研室,广东 广州 510006

    大黄具有广泛的药理作用如调节胃肠道蠕动、保护肝细胞、促进胰液分泌等[1],其中蒽醌和鞣质类成分对肝脏具有保护和损伤双向作用[2-4],大黄具有一定的肝毒性。因此,进一步深入探究大黄的肝毒性作用机制,减少不良反应具有重要的意义。近年来,网络药理学和分子对接技术在中药研究领域中的应用越来越受到关注[5]。通过构建网络药理学可在复杂体系中寻找大黄毒性物质、预测已知化合物的不良反应[6];分子对接技术可以通过模拟药物化合物与蛋白靶点的结合,预测它们的结合模式及结合自由能[7],验证筛选的核心成分与关键靶标是否能有效结合。本研究将2 种技术相结合探讨大黄肝毒性的核心成分、关键靶点及毒理机制,为为进一步探究大黄的肝毒性提供了新的线索。

    1 材料与方法

    1.1 大黄活性成分和潜在肝毒性成分的筛选

    TCMSP 数据库输入“大黄”,获得大黄活性成分,以生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18 为条件进行筛选。查找文献对筛选的大黄活性成分进行肝毒性验证和获取其他潜在肝毒性成分。

    1.2 大黄活性及潜在肝毒性成分作用靶点的预测

    在PubChem 数据库输入TCMSP 数据库获取的活性成分及文献获取的潜在肝毒性成分对应InChIKey 信息,将大黄成分转化为标准Canonical SMILES 格式,导入SwissTargetPrediction 数据库,获得大黄活性及潜在肝毒性成分靶点,结合TCMSP数据库对大黄成分靶点进行补充。

    1.3 人类肝毒性相关靶点的获取

    在GeneCards、OMIM 数据库中输入“liver toxic”,集合数据库靶点并去重得到人类肝毒性相关靶点。

    1.4 预测大黄肝毒性潜在作用靶点

    将1.2 项下获取的大黄成分作用靶点与1.3 项下获取的人类肝毒性相关靶点导入在线韦恩平台取交集 ......

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