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编号:1277716
基于网络药理学和分子对接探讨白藜芦醇治疗乙型病毒性肝炎相关性肝癌的作用机制
http://www.100md.com 2024年3月1日 现代药物与临床 2024年第2期
1材料与方法,1白藜芦醇靶点的筛选,2乙型病毒性肝炎相关性肝癌的靶点筛选,3“药物–疾病–靶点”网络分析,4蛋白相互作用(PPI)网络构建与分析,5基因本体(GO)和京都基因组百科全书
     吴成宪,王益,刘赋斌

    武汉科技大学附属天佑医院,湖北 武汉 430000

    肝细胞癌已成为世界范围内癌症死亡的主要原因。乙型病毒性肝炎是由于乙型肝炎病毒(HBV)感染导致,可引起个体患肝细胞癌的风险增加[1-2]。既往研究表明,我国是全球乙肝患者数量最多的国家,乙型病毒性肝炎患者的肝脏疾病进展与病毒的活性复制密切相关,发展到一定程度会引发肝细胞癌变[3-5]。这对人类的生存造成了极大的威胁,目前治疗肝癌的主要手段是肝切除术,此外,新辅助治疗、辅助治疗、靶向治疗、免疫治疗等近年来也逐渐兴起。白藜芦醇是一种非黄酮类多酚有机化合物,是许多植物受到刺激时产生的一种抗毒素。既往研究表明葡萄内含有较为丰富的白藜芦醇[6],而体外实验及动物实验结果显示白藜芦醇有抗氧化、抗炎、抗癌及心血管保护等作用[7-11]。研究表明,白藜芦醇可能通过调节蛋白激酶B(Akt)信号通路来治疗乙型病毒性肝炎相关性肝癌,但其内在机制仍不明确[12-13]。

    网络药理学是一门综合了药理学和计算机科学的交叉学科,其基于生物网络平衡原理,用以解释疾病的病理生理过程[14]。通过对广泛数据库的深度挖掘,建立了一个复杂的“药物–靶点–疾病”相互作用网络,着重强调了多靶点和多信号通路的调控机制。这一领域为中西医结合治疗提供了深远的理论指导。本研究运用网络药理学和分子对接技术对白藜芦醇在治疗乙型病毒性肝炎相关性肝癌中的潜在靶点和信号通路进行了预测,并揭示了其可能的作用机制。这些结果为未来的临床应用和深入研究提供了重要的学术支持。

    1 材料与方法

    1.1 白藜芦醇靶点的筛选

    通过数据库PubChem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)得到化合物白藜芦醇化学结构,并保存对应Canonical SMILES 号,将得到的白藜芦醇的SMILES 号分别输入到 Swiss Target Prediction(https://swisstargetprediction.ch)和Target Net 数据库(https://targetnet.scbdd.com)中,种属定义为“Homo sapiens”“probability>0”,剔除重复靶点后筛选得到白藜芦醇的潜在靶点。

    1.2 乙型病毒性肝炎相关性肝癌的靶点筛选

    通过GeneCards(https://www.genecards.org)、OMIM(https://www.omim.org)、DisGeNET(https://www.disgenet.org/)数据库对关键词“hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma”进行检索 ......

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