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编号:1623296
基于网络药理学和分子对接探讨丹参治疗乳腺癌的作用机制
http://www.100md.com 2024年3月26日 现代药物与临床 2024年第3期
丹参酮,靶点,1资料与方法,1药物活性成分及靶点的获取,2疾病靶点预测与药物-疾病交集靶点的筛选,3网络构建与分析,4基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,5药物活性成分与
     陈梦,陈瑶,杨向竹,赵丕文*

    1.北京中医药大学 中医学院,北京 102488

    2.北京中医药大学 生命科学学院,北京 102488

    乳腺癌已成为全球发病率最高的癌症类型,2020年乳腺癌已跃升成为全球女性癌症发病率和死亡率首位,严重威胁着女性的健康和生命[1-2]。手术和化疗是目前临床治疗乳腺癌的常用手段,但是不良反应较大,治疗效果也有待提高。中药的药理作用广泛,对乳腺癌的治疗具有积极的意义,在术后干预过程中也体现出较大的优势,具有良好的应用前景。

    丹参为唇形科草本植物丹参SalviamiltiorrhizaBge.的干燥根及根茎,味苦,性微寒,具有活血祛瘀、通经止痛等功效,在临床具有广泛的应用[3-4]。丹参及其有效成分抗乳腺癌的作用已经被多项研究证实[5-7]。本研究利用网络药理学方法[8]筛选丹参的成分、乳腺癌靶点及丹参治疗乳腺癌的核心靶点,并通过分子对接技术验证活性成分与靶点的亲和力,探讨丹参治疗乳腺癌的作用机制,为临床治疗提供进一步的理论参考。

    1 资料与方法

    1.1 药物活性成分及靶点的获取

    利用中药系统药理学平台TCMSP数据库(http://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)检索丹参的有效成分及对应的靶点。在UniProt数据库(http://www.uniprot.org/)中将靶点蛋白转换为统一的基因名称。

    1.2 疾病靶点预测与药物-疾病交集靶点的筛选

    在GeneCards(https://www.genecards.org)、OMIM(http://www.omim.org)、TTD(https://db.idrblab.net)中以“breast cancer”为检索词获取乳腺癌相关的靶点信息。将药物与疾病的靶点基因导入Excel,映射得到药物与疾病的共同靶点,通过在线作图网站(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)绘制韦恩图。

    1.3 网络构建与分析

    建立相关疾病、药物、药物成分与交集靶点相关的network和type文件,导入到Cytoscape 3.8.0软件中,构建完整的“药物-成分-疾病-靶点”网络图,探究丹参及活性成分治疗乳腺癌的多个靶点的作用机制。将疾病-药物交集靶点导入STRING数据库(https://cn.string-db.org) ......

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