过表达LncRNA IFNG-AS1急性淋巴细胞白血病细胞株的定量蛋白质组学分析
通路,1材料与方法,1材料与试剂,2细胞系,细胞培养和慢病毒侵染,3qRT-PCR检测,4蛋白质提取,胰蛋白酶消化和TMT标记,5高效液相色谱(HPLC)分离,6液相色谱-质谱(
吴 珊,蒋 丹,徐广贤(1.宁夏医科大学临床医学院,银川 750004;2.广东医科大学医学技术学院医学检验系,东莞 523000)
急性淋巴细胞白血病(ALL)起源于淋巴祖细胞在骨髓、血液和髓外部位的恶性转化和异常增殖,5年的总存活率为45%~90%。ALL的发病率呈双峰分布,第一个高峰发生在儿童时期,第二个高峰发生在50岁左右[1]。尽管诱导化疗的反应率很高,但只有30%~40%的成年ALL患者能实现缓解。长链非编码RNA(LncRNA)IFNG-AS1,又称TMEVPG1或NeST,最初发现是由于小鼠对Theiler病毒反应差异[2]。研究[3]表明,IFNG-AS1调控IFN-γ表达,以及调控Theiler病毒和沙门氏菌的应答。同时,IFNG-AS1在免疫性疾病和肿瘤中高表达,如垂体腺瘤、炎症性肠病、类风湿关节炎、乳腺癌和宫颈癌等。然而,关于IFNG-AS1在ALL中的机制作用研究较少。本研究通过构建IFNG-AS1过表达细胞系,以验证IFNG-AS1过表达的体外效果,以期为ALL发病机制中涉及的靶点提供新的思路。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
急性淋巴细胞白血病jurkat T细胞株源于本实验室保存。RPMI 1640培养基(01-100-1A)和胎牛血清FBS(04-001-1A)购于美国Biological Industries公司;TMT Mass Tagging Kits(90064B)、RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit(K1622)和SYBR Green qPCR Supermix(11733046)均购于美国Thermo Fisher Scientific公司;碘乙酰胺(IAA,144-48-9)、二硫苏糖醇(DTT,16096-97-2)、尿素(57-13-6)、乙二胺四乙酸(EDTA,60-00-4)和硼氢化四乙基铵(TEAB,17083-85-1)均购于美国Sigma公司;可表达绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)的慢病毒购于北京合生基因公司。
1.2 细胞系、细胞培养和慢病毒侵染
将jurkat T细胞株置入含5%胎牛血清和1%青霉素/链霉素1640培养基中培养细胞(37℃,5%CO2)。慢病毒侵染jurkat细胞后通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证病毒侵染效率。
1.3 qRT-PCR检测 ......
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