陈 国，田黎民，李晓平

    (1.广东省汕头潮南民生医院肿瘤综合外科，汕头 515154；2.湖北恩施土家族苗族自治州中心医院病理科，恩施 445000；3.广东省江门市中心医院胃肠外科，江门 529000))

    据统计，截至2020年美国每年结肠癌新发病例147 910例，死亡53 200例；我国结肠癌年新发病例约376 000例，死亡191 000例[1-2]。结肠癌已经成为最常见的消化道恶性肿瘤，严重威胁着人类健康。肠癌一旦发生区域淋巴结转移，则定义为Ⅲ期，而Ⅲ期肠癌的术后辅助治疗是基于5-氟尿嘧啶和奥沙利铂为基础的化疗方案。纵使接受了标准疗程的辅助治疗，仍有40%以上的患者出现复发转移[3-4]。分辨出Ⅲ期结肠癌患者中的高危患者、寻找潜在的治疗靶点具有重要意义。但目前针对Ⅲ期结肠癌的研究非常有限，本研究拟根据生物信息学方法，通过大数据平台筛选出影响Ⅲ期结肠癌患者预后的关键基因，以便为后续的实验室研究提供相应的靶基因。

    1 材料与方法

    1.1 筛选患者相关数据

    下载并筛选Ⅲ期肠癌患者的转录组核糖核酸测序(RNA-seq)数据和临床预后信息。从TCGA(https：//www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga)数据库中收集所有结肠癌患者RNA-seq数据和相关临床数据信(肿瘤位置包括升结肠、横结肠、降结肠和乙状结肠)[5]。从中筛选出临床分期为Ⅲ期的患者，共筛选出126例Ⅲ期结肠癌的患者，包含126例结肠癌的癌组织和8例癌旁组织。

    1.2 筛选差异表达基因

    NetworkAnalyst(https：//www.networkanalyst.ca)是一个专门用于转录组基因表达数据分析的在线网站[6]。在该网站中，以P<0.01以及|logFC|≥1为条件筛选出Ⅲ期结肠癌患者的癌组织和癌旁组织的差异表达基因。通过该网站绘制出描述差异基因表达情况的火山图。

    1.3 GO功能富集分析和KEGG通路富集分析

    对1.2中筛选出的差异基因进行功能富集分析和KEGG通路富集分析。具体步骤如下：首先，从NetworkAnalyst网站中得到差异表达基因的基因名称，通过Ensembl数据库，将所有差异表达基因的基因名装换为Gene symbol形式 ......