当前位置: 首页 > 期刊 > 《宁夏医科大学学报》 > 2022年第9期
编号:643592
宁夏一株人呼吸道合胞病毒B亚型全基因组基因特征分析
http://www.100md.com 2022年11月15日 宁夏医科大学学报 2022年第9期
核苷酸,原型,1材料与方法,1研究对象,2试剂及仪器,3方法,4序列分析,5全球代表株筛选,2结果,1呼吸道多病原检测结果,2核苷酸序列及其同源性,3全基因组系统发生树分析,4G基因组系统发生树分析,3讨论
     王新宁,吴忠兰,李宗倍,吴玉灵,苏艳艳,马学平

    (1.宁夏医科大学公共卫生与管理学院;宁夏环境因素与慢性病控制重点实验室,银川 750004;2.宁夏疾病预防控制中心,银川 750004)

    人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)是婴幼儿、老年人和免疫功能低下人群急性下呼吸道感染的重要病原体之一[1]。HRSV引起2岁以下儿童急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infections,ALRTI)的感染率高达97%[2],常见症状为咳嗽、咳痰、发热、呼吸困难和喘憋[3]。HRSV只有1个血清型,根据其对单克隆抗体的抗原性和遗传性的差异可分为HRSV-A和HRSV-B两大亚型:根据G蛋白的第二高变区(the second hypervariable region in the G protein,HVR2)的核苷酸序列的基因特征,将HRSV-A划分为18个基因型(GA1~7、ON1~2、NA1~4、SAA1~2、TN1~2和CBA)[4-7],将HRSV-B划分为39个基因型[BA1~14、GB1~13、SAB1~4、BAc、URU1~2、CB1(GB5)、CBB、BA-CCA、BA-CCB和THB][5,8-10]。本研究对2020年宁夏地区新型冠状肺炎流行期间具有下呼吸道感染症状的人群进行多病原检测,并对其中一株HRSV-B全基因组序列进行了测定,结合GenBank数据库中世界其他地区报道的56株HRSV-B亚型病毒G基因组序列进行了对比分析,研究其基因特征,丰富了我国HRSV基因数据库,也为HRSV的快速诊断方法的建立、评价预防性治疗单克隆抗体提供了核苷酸和氨基酸的基础数据。

    1 材料与方法

    1.1 研究对象

    从2020年1月20日至2020年11月20日宁夏地区具有呼吸道感染症状且新型冠状肺炎监测为阴性病例中随机选取480例为研究对象。所有研究对象在就诊后2 h内采集鼻-咽拭子、咽拭子、痰、肺泡灌洗标本,并尽快送往实验室保存于-80℃低温冰箱。所有患者及未成年人家属均签署知情同意书,自愿协助本次实验研究。

    采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(real time reverse transcription polymerase chain re-action ......

您现在查看是摘要页,全文长 9012 字符