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编号:643524
基于生物信息学预测迷迭香酸治疗子宫内膜癌的靶点和通路
http://www.100md.com 2022年2月15日 宁夏医科大学学报 2022年第12期
关键,1材料与方法,1迷迭香酸靶点的筛选,2子宫内膜癌相关靶点的检索,3迷迭香酸治疗子宫内膜癌的关键靶点网络构建,4GO功能及KEGG通路富集分析,5分子对接验证,2结果,1迷迭香酸的靶点预测,4迷迭香酸治
     曹礼慧,刘丽娟,袁中文,高珊珊,冯森玲

    (广州医科大学附属第三医院药学部广东省产科重大疾病重点实验室,广州 510150)

    子宫内膜癌是女性常见的恶性肿瘤之一。近年来其发生率和病死率不断升高,发病原因尚未完全明确,治疗方法主要是手术和放化疗[1]。迷迭香酸是一种天然多功能酚酸类化合物,因1958年首次从迷迭香植物中分离提取而得名[2]。研究[3-4]表明,迷迭香酸具有多种药理活性,如抗肿瘤、抗氧化、抗炎和抗菌等,对肝癌、卵巢癌、宫颈癌等均表现出明显的抑制作用。本研究通过数据库筛选出迷迭香酸的作用靶点,探索迷迭香酸治疗子宫内膜癌的作用靶点及其可能的作用机制,为后续开展分子生物学研究及动物实验提供理论基础。

    1 材料与方法

    1.1 迷迭香酸靶点的筛选

    检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)、比较毒理学数据库(CTD,https://ctdbase.org/)获取迷迭香酸的预测靶点信息,利用UniProt数据库(https://www.uniprot.org/)对靶点进行标准化处理。去除重复后筛选得到迷迭香酸的靶点。

    1.2 子宫内膜癌相关靶点的检索

    以“endometrial carcinoma”“endometrial cancer”为检索词,通过GeneCards数据库(https://www.genecards.org/)和DisGeNET数据库(http://www.disgenet.org/)获取子宫内膜癌的作用靶点。将所有靶点去重后得到子宫内膜癌的靶点。

    1.3 迷迭香酸治疗子宫内膜癌的关键靶点网络构建

    将“1.1”中迷迭香酸的预测靶点与“1.2”中子宫内膜癌的相关靶点取交集 ......

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