基因芯片分析Narasin 对雌激素受体阳性乳腺癌细胞基因表达的影响
差异基因,通路,1材料与方法,2方法,2结果,1Narasin处理后MCF-7细胞的DEGs分析,2GO富集分析,3KEGG通路分析,3讨论
蔡卫吉, 凌 珺, 王宝祯, 马 磊, 王彦凤, 李 涛, 陈 静(1.宁夏医科大学基础医学院,银川 750004; 2.宁夏医科大学生育力保持教育部重点实验室,银川 750004;3. 宁夏医科大学临床医学院,银川 750004; 4.宁夏医科大学总医院肿瘤医院肿瘤外二科,银川 750004)
乳腺癌是人类最常见的癌症之一,是一种具有不同组织病理学特征的异质性疾病,其发生发展是由多因素共同作用的结果[1-2]。研究[3-5]发现,年龄、家族史、月经初潮年龄或更年期年龄、生殖因素、雌激素和生活方式等均是导致乳腺癌发生的重要危险因素。近年来个体化治疗方案使乳腺癌各分子亚型的患者无病生存率和总生存率明显提高[6-7]。然而,我国乳腺癌发病率仍逐年上升,且发病年龄呈年轻化趋势[8-10]。因此,寻找新的治疗靶点对于提高乳腺癌患者的生存率及降低复发率具有重要意义。雌激素受体阳性(ER +)乳腺癌是最常见的乳腺癌亚型,约占所有乳腺癌的70%[11]。Narasin 是一种从白色链霉菌中分离出的羧基聚醚离子载体,目前作为一种治疗家禽球虫病的抗生素被添加在饲料中[12]。本课题组前期研究[13]发现,Narasin 能够通过TGF-β/SMAD 和IL-6/STAT3 信号通路来抑制ER+乳腺癌细胞的转移和生长,但具体机制还需要进一步探究。基于以上研究背景,本研究利用生物信息学方法分析经Narasin 作用后ER+乳腺癌细胞基因的改变,寻找其发挥作用的分子机制及关键靶标,以期为Narasin 抑制乳腺癌细胞增殖、转移提供更充分的理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 主要仪器设备 CO2培养箱(力康生物医疗科技控股有限公司);4 ℃低温离心机(Eppendorf 公司);ABI 9700 RCR 仪(ABI 公司);全波长酶标仪、NanoDropR2000、GeneChipRHybridization Oven 645、GeneChipRFluidics Station 450、GeneChipRScanner 3000 7G(Thermo Fisher 公司) ......
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