唐超峰， 柳科军， 陈本栋， 卜 阳

    (1.宁夏医科大学总医院肝胆外科，银川 750004； 2.宁夏回族自治区人民医院肝胆外科，银川 750002)

    肝癌是常见的原发性肝癌，占所有原发性肝癌的75%～85%，在全球癌症相关死亡原因中位列第4[1-2]。肝癌的发生、浸润和转移涉及多种癌基因、抑癌基因及生长因子，而转录调控是肿瘤细胞代谢和增殖等生物学行为的关键[3-4]。RNA结合蛋白(RNA-binding proteins，RBPs)在转录调控中有非常重要的作用，PUF 家族蛋白又称Pumilio RNA 结合家族蛋白(主要包括PUM1、PUM2 和PUM3)，是高度保守的RNA 结合域，主要参与基因负性调控和特异性识别碱基，参与干细胞分裂增殖、细胞周期、DNA 修复和细胞凋亡等过程，其功能障碍会导致神经退行性变、癫痫、共济失调、不育和恶性肿瘤[5]。既往研究[6-8]已证实，PUM1 在卵巢癌、非小细胞肺癌及淋巴细胞白血病等肿瘤中发挥致癌作用。目前关于PUM1、PUM2、PUM3 基因在肝癌发生发展中的具体作用并不清楚，因此，本研究基于多组学数据分析PUM1、PUM2、PUM3 基因在肝癌中的表达及其临床意义，以期为PUF 家族基因的临床应用提供一定的理论依据。

    1 资料与方法

    1.1 数据来源

    通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载肝癌患者临床信息和RNA 测序数据，去除重复样本后共纳入371 例肝癌组织基因表达谱样本和50 例癌旁组织基因表达谱样本。所有的表达数据都通过对数转换进行归一化处理。根据Z-score 标准化的中值，将纳入研究的患者分为高PUMs 表达组和低PUMs 表达组，分析PUM1、PUM2、PUM3 基因表达与患者临床病理特征的相关性。人类蛋白质图谱(https：//www.proteinatlas.org/)可以使用各种组学技术(包括免疫组织化学法、蛋白质组学、转录组学和系统生物学)来定位细胞、组织和器官中的蛋白质表达情况[9-11]。本研究从该数据库下载免疫组织化学图像来比较肝癌组织中PUMs 的蛋白质表达水平，并深入评估其蛋白质表达情况。String(https：//cn.string-db.org/)是已知和预测的蛋白质-蛋白质相互作用网络的在线数据库[12]，本研究联合Cytoscape 软件绘制PUMs 蛋白与前20 互作蛋白的网络图。cBioPortal for Cancer Genomics(https：//www.cbioportal.org/)是一个开放访问的开源资源 ......