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编号:776679
GEO芯片分析联合网络药理学探讨青风藤治疗特发性膜性肾病的作用机制
http://www.100md.com 2024年1月11日 健康研究 2023年第6期
靶点,通路,1材料与方法,2结果,3讨论
     江宜宏,郑佳新

    (黑龙江省中医药科学院,黑龙江 哈尔滨 150036)

    膜性肾病是成人肾小球肾炎的一种常见类型,根据病因分为特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)和继发性膜性肾病(secondary membranous nephropathy,SMN),其中75%表现为IMN,SMN多由临床疾病发展而来[1]。IMN具有病程反复、迁延难愈的特点,约80%的IMN患者临床表现为肾病综合征[2],目前临床治疗上主要依赖于激素、免疫抑制剂、ACEI和ARB类等药物[3]。然而,长期的西药治疗不仅给患者家庭带来巨大的经济负担,而且治疗后仍存在复发的可能,甚至伴随着严重的副作用。

    中药青风藤最早被用于治疗类风湿性关节炎,大量研究证实青风藤具有抗炎、镇静、镇痛作用,对非特异性免疫、细胞免疫和体液免疫均有抑制作用[4-5]。近年来,青风藤及其复方不断被应用在治疗膜性肾病等肾脏疾病上,临床上取得了显著疗效,但其具体作用机制尚未明确。本研究利用基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)对IMN相关差异表达基因进行分析,同时借助网络药理学探讨青风藤治疗IMN的关键靶点及相关通路,为进一步研究青风藤治疗IMN提供理论依据。

    1 材料与方法

    1.1 数据库及数据处理工具 本研究所用数据库包括TCMSP、GEO、Uniprot、STRING、DAVID 6.8、KEGG、PDB,数据处理工具包括Venny 2.1.0 在线平台、Cytoscape 3.9.0软件、Origin Lab 2020软件、Auto Dock1.5.7软件、Pymol软件、Open Babel软件。

    1.2 青风藤活性成分及对应靶点 在 TCMSP数据库中输入青风藤,设置条件为口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和类药性(drug like,DL)≥0.18,筛选出符合条件的青风藤活性成分及其对应的蛋白质靶点,并根据已发表的文献报道补充未预测到的活性化合物的已知靶点。筛选结束后,为规范青风藤活性成分及对应蛋白质靶点,借助Uniprot数据库(https://www.Unipmt.org)进行匹配规范 ......

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