基于计算机虚拟筛选研究菝葜抗肝癌的作用机制*
靶点,1材料与方法,2结果,3讨论
邝玉慧,徐方飚,陈晓琦,戴璐璐,谢抗,陈欣菊1.河南中医药大学第一附属医院,河南 郑州 450000; 2.中国中医科学院西苑医院,北京 100091; 3.广东药科大学中医药研究院,广东 广州 510006
原发性肝癌大多数为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称“肝癌”),占原发性肝癌85%[1]左右,是全球最常见的消化系统恶性肿瘤,其较高的病死率严重威胁人们的健康和生命。大多数患者确诊时已处于中晚期,失去了手术的机会,而靶向治疗、介入治疗及放化疗的不良反应会进一步加重肝脏负担。中医药是中华民族文化的瑰宝,中医药防治肿瘤有自己独特的特色和优势,在西医治疗手段的基础上加强中医药疗法,不仅能够提高肝癌患者的生存率及生活质量,而且能够减轻放化疗带来的不良反应,增强患者的免疫力。
菝葜为百合科植物菝葜(SmilaxchinaL) 的干燥根茎,又名金刚藤,2015年版《中华人民共和国药典》记载菝葜具有利湿去浊、祛风除痹、解毒散瘀的功效。现代药理研究发现,菝葜可以抑制肿瘤细胞的增殖、诱导肿瘤细胞的凋亡,激活巨噬细胞和增强宿主免疫系统功能,临床上也常用于治疗肿瘤的组方中。菝葜具有多成分、多靶点、多途径的相互作用特点,而目前对菝葜的研究多集中针对某一疾病的某一个作用机制,缺乏对其机制系统的研究。
虚拟筛选是利用计算机进行分子对接模拟,帮助筛选小分子药物的一项技术。网络药理学融合了系统生物学、信息网络学和计算机科学,将网络药理学与网络分析相结合,能够系统预测和揭示药物、化学成分、基因、靶点与疾病之间相互关系和作用机制。利用网络药理学和虚拟筛选[2]多层次构建网络模型,是从整体的视角研究中医药,阐释中药有效性和科学性的新方式。因此,本研究通过网络药理学及分子对接技术预测菝葜抗肝癌的潜在作用靶点和通路,明确其作用途径。
1 材料与方法
1.1 数据库与软件应用中药系统药理学数据库与分析平台(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php);Uniprot数据库(https://www.uniprot.org);疾病数据库Genecard(https://www.genecards.org/)、PharmDB-K数据库(http://pharmdb.org/)、GAD数据库(https://geneticassociationdb.nih.gov/);数据分析软件STRINGR(http://string-db.org/cgi/input.pl);基因本体 (gene ontology ......
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