当前位置: 首页 > 期刊 > 《中医学报》 > 2023年第9期
编号:632332
基于加权基因共表达网络分析探究养肺方治疗非小细胞肺癌的作用机制及实验验证*
http://www.100md.com 2023年9月11日 中医学报 2023年第9期
含药,差异基因,货号,1基于网络药理学和加权基因共表达网络分析探究养肺方治疗非小细胞肺癌的作用机制,2基于PI3K,AKT通路研究养肺方对NSCLCPC9细胞凋亡的影响,3讨论
     庄垚雪,林事成,刘殿娜,高磊,孙静宜,魏佳,李泉旺

    1.北京中医药大学,北京 100029; 2.北京中医药大学东方医院,北京 100078

    肺癌是全球范围内发病率较高的一类疾病,其死亡率位居各类癌症的第一名,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)约占肺癌的85%[1-2]。NSCLC早期治疗以根治性手术联合放化疗为主,中晚期治疗以放化疗为主,复发率较高,生存期不佳[3]。多项国内外研究证明,中医药具有较好的抗肿瘤辅助治疗及对症支持治疗疗效,能够显著提高肿瘤患者的总生存期[4-6]。首都名医王沛教授认为肺癌的主要病机是正气内虚,从而导致肺络受损、痰瘀毒聚,故以益气养阴为法,以“扶正”作为治疗之本,以沙参麦冬汤为基础,自拟养肺方以滋阴扶正、解毒散结,临床观察表明具有较高的安全性及较好的临床疗效[7-8]。本文首先通过网络药理学联合加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)初步探究养肺方治疗非小细胞肺癌的核心靶点、关键通路,然后基于非小细胞肺癌PC9细胞进行实验验证,以期为临床养肺方抗肺癌的应用及中医药防癌治癌机制的阐明提供参考。

    1 基于网络药理学和加权基因共表达网络分析探究养肺方治疗非小细胞肺癌的作用机制

    1.1 资料与方法

    1.1.1 养肺方活性成分、靶点的筛选在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)[9-10]查找养肺方组方中药的化学成分,筛选条件为口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、类药性指数(drug-likeness,DL)≥0.18,确定养肺方的活性成分。利用中医药百科全书(the encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)预测养肺方活性成分相关靶点[11],以Tanimoto>0.8作为筛选标准,获得养肺方的总靶点。

    1.1.2 差异基因分析运用GEO平台[12]下载基因芯片GSE118370。采用GEO2R归一化数据并分析差异基因,差异基因筛选标准:|logFC|≥1且P2倍中位数”,筛选养肺方治疗NSCLC的有效药效成分。

    1.1.5 蛋白相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)网络的构建将WGCNA中筛选出的Hub基因与药物靶点取交集得到治疗靶点,导入STRING11.15平台[11,14]进行PPI网络构建,通过Cytoscape 3.7.2中的CytoHubba[15]筛选出核心治疗靶点 ......

您现在查看是摘要页,全文长 13545 字符