基于网络药理学与分子对接研究扶正感康丸治疗新型冠状病毒感染的作用机制*
黄芩,靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
张明利,符诚,潘晔,王欣1.河南省中西医结合医院,河南 郑州 450004; 2.河南中医药大学,河南 郑州 450046
扶正感康丸由《医学入门》中的经典名方御寒汤化裁而来[1],第四批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师李发枝教授在肺系疾病的治疗中善于应用此方[2-3],根据患者不同的病情加减化裁,均能取得较好疗效,笔者在继承李教授学术思想的基础上,结合自身丰富的临床经验,研制出扶正感康丸,治疗新型冠状病毒感染及转阴后肺脾气阴亏虚证患者具有不错的疗效。但由于扶正感康丸的基础药理研究较少、具体作用机制尚不明晰等问题,制约了其进一步发展。本研究通过对扶正感康丸组方中12味中药进行功效分析,选择原方中的君药及臣药(黄芪、苍术、白芷、防风、黄芩、升麻)进行网络药理学分析,进一步探究扶正感康丸干预新型冠状病毒感染的作用机制,为其临床应用及进一步推广提供理论支持。
1 资料与方法
1.1 扶正感康丸有效作用成分及相关靶点的获取采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)、草本组鉴(http://herb.ac.cn/,HERB)联合检索扶正感康丸6味核心药物(黄芪、苍术、白芷、防风、黄芩、升麻)的化学成分及相关靶点。两者均未能检索出相关靶点的成分,通过HERB、PubChem查询化学成分的SMILES,通过SwissTargetPrediction(http://www.swisstargetprediction.ch/)、STITCH(http://stitch.embl.de/,STITCH)、Similarity ensemble approach (https://sea.bkslab.org/,SEA)、SuperPred(https://prediction.charite.de/subpages/target_prediction.php)多个数据库进行靶点预测,去掉重复靶点,得到最终的预测靶点。通过Uniport将活性成分相关靶点进行标准化后,将6味核心药物、活性成分及相关靶点的数据进行整理,通过Cytoscape软件构建“核心药物-活性成分-靶点”网络,并采用Analyze Network功能分析活性成分相关靶点的对应关系,以发现核心成分。
1.2 新型冠状病毒感染疾病靶点的获取及其与活性成分相关靶点交集靶点的获取分别在Genecards数据库(https://www.genecards.org)、国家生物技术信息中心数据库(National Center for Biotechnology Information,NCBI,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库(https://www.genome.jp/kegg/)中以“新冠肺炎”为关键词获取相关疾病靶点 ......
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