基于生物信息学分析银屑病基因表达差异及潜在中药*
角质,皮损,1资料与方法,2结果,3讨论
刘小琨,张苍,王翊同1.北京中医药大学,北京 100020; 2.首都医科大学附属北京中医医院皮肤科/北京市赵炳南皮肤病医疗研究中心,北京 100010
银屑病是一种免疫介导的慢性炎症性皮肤病,典型皮损表现为鳞屑性红斑或斑块,局限或广泛分布[1]。银屑病的发病机制尚不完全清楚,目前临床普遍认为银屑病是T细胞和树突细胞介导的多基因疾病,以遗传背景为基础,以外界环境对免疫系统的刺激为诱因,以角质细胞的异常增生和局部炎症为主要病理表现[2-3],感染、吸烟、寒冷干燥、焦虑、睡眠障碍等均是本病的危险因素[4-5]。1984—2017年间,我国的银屑病发病率由0.123%上升到0.500%[6-7],且该病具有难治愈、高复发、病程长的特点[8]。银屑病尚无治愈方法,目前的治疗手段主要包括维A酸类、维生素D3类、糖皮质激素、免疫抑制剂、生物制剂和光疗等[9]。上述治疗方法虽可有效缓解银屑病的病情,但长期使用存在感染风险增加、患恶性肿瘤风险升高、引发代谢性疾病和治疗费用昂贵等问题。在保证安全性的前提下,长期控制病情、提高患者生活质量,是当前治疗银屑病的目标。预防和延缓银屑病的复发是长期改善患者生活质量的有效途径,也是治疗的难点。因此,进一步探究银屑病的发病机制,开发新的药物是有必要的。
银屑病属中医“白疕”范畴。笔者认为,“内有蕴热、郁于血分”是银屑病的基本病机,“从血论治”是银屑病的基本治则。中医辨证施治银屑病,一般分为“血热、血瘀、血燥”3种证型论治,对改善银屑病的长期预后、预防银屑病复发存在一定优势[1]。本研究从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)获得原始数据,通过生物信息学方法探索与银屑病相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其中的核心基因进行功能和通路的富集分析,探究银屑病的病理机制与治疗靶点,再将核心基因与中药相互映射,为对银屑病治疗靶点有潜在干预作用的中药提供理论支持,为银屑病病理机制和潜在中药的研究提供思路。
1 资料与方法
1.1 数据提取在美国国立生物技术中心的CEO[10]中检索与银屑病相关的数据集,提取GSE161683、GSE193128、GSE137218数据集的原始数据,所有数据集中样本均取自银屑病患者,其中银屑病组为受累皮损,对照组为非受累的正常皮肤,仅保留基线期未进行干预的组织学样本进行DEGs筛选。各基因芯片的芯片平台、样本例数、组织类型等详细信息见表1。
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