当前位置: 首页 > 期刊 > 《中国医药科学》 > 2019年第24期
编号:123434
与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络构建
http://www.100md.com 2019年2月15日 中国医药科学 2019年第24期
1资料与方法,1一般资料,2数据预处理,3共表达网络构建,4共表达网络与临床资料相关性分析,5通路分析,2结果,1共表达网络构建,2不同共表达模块与患者生存期相关性,3通路分析,3讨论
     徐晓文 何玉琪 张 露 潘名志 杨旭娜 惠 李 谷晓楚

    1.江苏省苏州市广济医院临床检验科,江苏苏州 215008;2.江苏省苏州市广济医院医务部,江苏苏州 215008;3.江苏省苏州市广济医院科教部,江苏苏州 215008

    胶质瘤是一种起源于神经胶质细胞的恶性肿瘤,是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤[1]。根据病理评估,WHO将胶质瘤分为低级别和高级别两类,其中低级别胶质瘤分化良好、多为良性、预后较好;而高级别胶质瘤为未分化、恶性、预后较差,如多形性胶质母细胞瘤中位生存时间约为15个月[1]。癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)是目前全球最大的癌症基因信息数据库,提供不同种类癌症基因突变、表达和甲基化等信息以及患者临床资料,这为采用系统生物学方法研究肿瘤发生发展、识别决定多形性胶质母细胞瘤患者预后的关键因素提供了研究资料[2]。本研究采用权重基因共表达网络(Weighted Gene Co-Expression Network,WGCNA)分析构建了多形性胶质母细胞瘤权重基因共表达网络,并与患者生存期进行相关性分析,筛选出与生存期显著相关的共表达模块,并进一步利用通路富集分析软件对模块中的基因进行通路分析,从而为多形性胶质母细胞瘤临床治疗提供参考依据。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料

    本研究纳入的胶质瘤患者临床资料和胶质瘤组织RNA测序数据全部从TCGA数据库获得 ......

您现在查看是摘要页,全文长 5518 字符