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编号:118371
CXCL5在肾透明细胞癌中的表达及其诊断预后价值
http://www.100md.com 2021年11月19日 中国医药科学 2021年第19期
肾癌,测序,通路,1资料与方法,1获取临床和基因测序数据,2CXCL5mRNA表达量差异分析,3Oncomine数据库验证CXCL5mRNA表达量,4CXCL5mRNA表达量与临床特征的相关性,5CXCL5mR
     黄坤平 冯子豪 葛 波▲

    1.桂林医学院第二附属医院泌尿外科,广西桂林 541199;2.桂林医学院,广西桂林 541004

    肾癌是发病率排名前三的泌尿系统恶性肿瘤[1]。在肾癌所有病理类型中,肾透明细胞癌是最常见、病死率最高的,占75%~80%[2]。肾癌早期多缺乏临床表现,容易错过早期诊断而延误治疗[3]。而晚期肾癌患者预后差,治疗手段少。因此,寻找一种肾癌早期检测和判断预后的标志物具有重要的临床意义。研究表明,趋化因子不仅参与免疫反应,还参与肿瘤增殖、侵袭转移等生物学过程[4-5]。CXCL5作为趋化因子的一员,有研究表明,其在肝癌[6]、胆管癌[7]、大肠癌[8]、前列腺癌[9]等肿瘤中高表达,并通过多种机制调控肿瘤增殖、迁移。但CXCL5基因在肾癌中的相关研究还较少。因此,本研究旨在利用数据库和生物信息学方法探讨CXCL5在肾癌中的表达情况、诊断及预后价值、作用机制。

    1 资料与方法

    1.1 获取临床和基因测序数据

    从 TCGA数据库(https://portal.gdc.ancer.gov/pository)下载肾透明细胞癌高通量RNA测序数据和临床数据。共获取539例肾透明细胞癌和72例癌旁正常肾组织的样本,其中肾透明细胞癌与癌旁正常肾脏组织的样本配对72例。

    1.2 CXCL5 mRNA表达量差异分析

    将RNA测序数据区分为肾透明细胞癌组织组和癌旁正常肾组织组,使用R软件进行基因差异表达及配对差异分析,比较CXCL5 mRNA在肾透明细胞癌与癌旁正常肾组织的表达量差异。

    1.3 Oncomine数据库验证CXCL5 mRNA表达量

    作为TCGA外的大型癌症基因库,Oncomine数据库(https://www.oncomine.org/resource/login.html)可实现诸多功能 ......

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