基于网络药理学研究黄精丸防治阿尔茨海默病的作用机制
磷酸化,靶点,1材料与方法,1分析软件及数据库,2黄精丸活性成分筛选及作用靶点预测,3疾病靶点及药物与疾病靶点交集预测,4蛋白质相互作用(PPI)网络的构建,5构建成分-靶蛋白-信号通路网络,6GO(Gene
李 莉 李 钰 杨绍杰1.电子科技大学医学院附属妇女儿童医院·成都市妇女儿童中心医院药学部,四川成都 611731;2.西南医科大学,四川泸州 646000;3.成都市慢性病医院神经内科,四川成都 610017
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是1906年首次由德国精神病学家和神经病学家Alzheimer Alois发现,并以其名字命名的一种慢性神经退行性疾病,是老年期痴呆最常见的一种类型,也是导致老年人失能的重要原因之一[1]。据Alzheimer’s Association报道,预计到2050年AD患者将接近1.14亿,每33秒就会新增一位AD患者[2]。目前AD可能的发病机制有β淀粉样蛋白毒性学说、tau蛋白过度磷酸化学说、胆碱能学说、氧化应激学说等[3]。然而没有任何一种假说能全面解释AD所有的病理特点,目前主要认为是多种因素共同作用的结果。而目前对于AD的药物研究方面,临床上主要使用西药治疗,如胆碱酯酶抑制剂、兴奋性氨基酸受体拮抗剂、脑蛋白水解物及其他缓解AD症状的药物[4]。这些药物虽然可使患者痴呆症状相对减轻,但引发的不良事件也较多。
近年来,应用中药提取物及其衍生药物治疗AD的研究日益增多。与西药相比,我国特有的中药具有治疗效果较好、毒副作用较低等优点。据杨晶莹等[5]的研究,古方黄精丸具有潜在防治AD作用。从黄精丸防治AD相关的试验与临床研究结果来分析,黄精丸与地黄饮子[6]、开心散[7]等中药复方相似,具有多层次、多靶点、多方向防治AD的特点,而有关黄精丸防治AD的相关研究还处在空白阶段,有关该复方的相关试验及临床研究报道极少,现有的相关研究尚未完全阐明其作用机制,并且由于中药成分的多样性和作用机制的多靶点、多通路,传统的研究方法很难实施。而近年兴起的网络药理学是基于网络观点,从系统水平分析药物作用机制、发现先导化合物或新适应证、识别新药靶点的一种新的研究角度,其与中医药整体调控机体的理念相吻合,同时也能大大降低后续试验研究的工作量[8]。因此本研究将网络药理学思路应用于黄精丸防治AD的作用机制探讨,旨在为后续的试验研究方向提供一定的信息支撑,并将经典中药古方发扬光大。
1 材料与方法
1.1 分析软件及数据库
主要包括中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、DrugBank数 据 库、UniProt数 据 库、GeneCards数 据 库、OMIM数据库、String数据库、Venny 2.1、R 4.0.3、Cytoscape 3.8.1等软件 ......
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