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编号:113076
系统性红斑狼疮B细胞差异表达基因生物信息学分析
http://www.100md.com 2022年9月18日 中国医药科学 2022年第15期
靶点,编码,通路,1资料与方法,1转录组数据集,2差异表达基因筛选,3DEGs功能分析,4蛋白互作网络(protein-proteininteraction,PPI)分析,5统计学分析,2结果,1SLE患者B细胞
     黄 晶 郜赵伟 郭文涛 董 轲

    空军军医大学唐都医院检验科,陕西西安 710038

    系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是中青年女性常见自身免疫病之一,可累及全身各系统。免疫失调既是SLE患者主要临床表现之一,也是其发生发展的重要驱动要素。SLE患者免疫失调表现多样,包括B细胞[1-2]、T细胞[3]、单核-巨噬细胞[4]等多种免疫细胞异常。其中B细胞免疫异常是SLE研究热点之一。SLE治疗药物Belimumab通过靶向B淋巴细胞刺激因子,抑制B细胞生存及其向浆细胞分化,缓解病情[5]。因此,B细胞异常在SLE发生发展中作用关键。本研究筛选SLE患者B细胞差异表达基因,并进行功能分析,为探讨SLE发病机制和筛选潜在治疗靶点提供参考。

    1 资料与方法

    1.1 转录组数据集

    GSE4588数据集包括7例SLE患者和9例健康者B细胞转录组信息;GSE10325数据集包括14例SLE患者和9例健康者B细胞转录组信息;GSE30153数据集包括17例SLE患者和9例健康者B细胞转录组信息。

    1.2 差异表达基因筛选

    利用GEO2R分析工具筛选各数据集中SLE患者B细胞差异表达基因(differential expression genes ......

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