邵珊珊 黄俊星▲ 张 虎 金红松

    1.江苏省泰州市人民医院肿瘤科，江苏泰州 225300；2.江苏省泰州市人民医院急诊外科，江苏泰州 225300

    进入21世纪以来，皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma，SKCM)的发病率以每年3%～5%的速度快速上涨[1]。由于其具有高度的恶性和侵袭性，导致大多数皮肤癌患者病死。SKCM 已成为严重的公共卫生问题[2]，给社会带来巨大的经济负担。因此，寻找合适的预后标志物对提供新的治疗靶点具有重要临床价值。趋化因子是一个大家族的低分子量(8～14 kDa)趋化细胞因子，其与特定受体结合，并在受体细胞中引发定向趋化运动，调节肿瘤细胞的生长和增殖、血管形成、肿瘤干细胞样细胞特性、侵袭和转移[3]，直接和间接地影响肿瘤免疫和癌症进展。CXC 是这个家族的重要成员[4]，肿瘤微环境中的CXC 趋化因子可以调节免疫细胞转运和肿瘤细胞活性，起到抗肿瘤免疫的作用，影响患者预后[5]。然而趋化因子CXC 在SKCM 中的表达水平及对预后的影响尚不清楚。有研究报道了CXC 趋化因子在SKCM 中的表达和功能[6]，但尚不清楚哪种CXC 趋化因子可作为SKCM 预后的生物标志物。本研究将从CXC 趋化因子中寻找可作为SKCM 预后的标志物，并试图揭示其影响SKCM预后的机制。

    1 资料与方法

    1.1 患者样本

    本研究包括两个独立数据集：①肿瘤与癌症基因组图谱(the cancer genome atlas，TCGA)，提供了472 位SKCM 患者的转录组信息和临床信息；②组织基因型表达图谱(genotype-tissue expression，GTEx)的正常人转录组信息和临床信息。TCGA 患者特征下载自http://www.portal.gdc.cancer.gov。GTEx 患者特征下载自http://commonfund.nih.gov。

    1.2 Oncomine

    Oncomine 数据库是肿瘤相关基因研究的数据库，整合了TCGA、基因表达综合数据库(gene expression omnibus data base，GEO)和已发表的文献等来源的RNA 和DNA-seq 数据[7]。在本研究中，利用Oncomine 数据库检索功能，导出17 种CXC趋化因子mRNA 在SKCM 中的表达差异图(设定P-value 阈值为0.05，Fold Change 阈值为2，Gene Rank 阈值为TOP 10%) ......