桥本氏甲状腺炎和乳头状甲状腺癌核心蛋白的筛选及临床意义
蛋白质,1材料与方法,2方法,2结果,1HT与PTC的共同基因,2蛋白质相互作用与核心蛋白,3细胞增殖和血管发生的生物学过程富集分析,4信号通路富集分析,3讨论
高 丹 吴 影 李丽娟 李化敏 付雪莲 郭素芬 展 涛牡丹江医学院附属红旗医院病理诊断中心,黑龙江牡丹江 157000
甲 状 腺 癌(thyroid cancer,TC)发 病 率 约8.7/100 000[1],乳头状甲状腺癌(papillary thyroid cancer,PTC)占TC的64.21%,是最常见的甲状腺恶性肿瘤类型[2]。近年来,甲状腺结节发病率日益增多,多数甲状腺结节是“非典型性增生”病变,如果发生迅速增长的甲状腺结节,应怀疑甲状腺恶性肿瘤,但是高效预测TC的检测手段还需要深入探索。Sur等在分子层面检测甲状腺结节组织的炎症基因表达,结果发现PTC常伴有不同程度的甲状腺炎表现。40%PTC病理标本表现出桥本甲状腺炎(hashimoto’s thyroiditis,HT)特征[4]。这不仅证明PTC和HT的病理演变关系,还揭示HT与PTC均有大量T细胞、浆细胞、肥大细胞和巨噬细胞浸润,这反映了免疫系统在HT与PTC区域产生相似作用[5],虽然进一步解释了HT与PTC的密切关联性,但是这两种疾病的发生、演变的基因表达差异还要深入研究。揭示HT与PTC共同基因,筛查两种疾病的核心蛋白及潜在分子机制,将对判断HT发展和确诊PTC具有重要临床价值。
1 材料与方法
1.1 材料
DisGenet数据库(www.disgenet.org),生物信息学与进化基因组学平台(bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn),UniProt数 据 库(www.uniprot.org),Metascape数据库(metascape.org),String 11.0数据库(https://string-db.org)。
1.2 方法
1.2.1 HT和PTC基因表达谱 DisGenet数据库获得C0677607和C0238463数据集 ......
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