基于网络药理学和生物信息学探讨夏天无治疗胃癌的机制
靶点,受体,1材料与方法,1夏天无潜在成药成分及对应靶点的确定,2胃癌相关靶基因获取,3“夏天无有效成分-靶基因-胃癌”网络构建,4靶蛋白与靶蛋白相互作用(protein-proteininteraction
黄文安 何智博 刘 俊▲1.九江学院医学院,江西九江 332005;2.九江学院外国语学院,江西九江 332005
夏天无为罂粟科紫堇属延胡索亚属植物伏生紫堇的块茎,主产于江西、湖南、福建、浙江、安徽等省份,以江西产质量为佳,具有活血通络、行气止痛的功效[1]。夏天无在临床上常用于治疗心脑血管系统疾病、腰椎间盘突出症、坐骨神经痛、风湿性关节炎等[2]。虽然夏天无的临床疗效显著,应用广泛,但其在癌症治疗中研究较少,对癌症的治疗也仅限于对胃癌疼痛有减轻效果[3],并且不良反应率低。但是夏天无的药理学研究基础相对薄弱,尤其对其单体的抗癌活性及作用机制缺乏系统深入的研究。
中医药治疗和预防癌症在中国有着悠久的历史,因其在一定程度上能够协同增效和降低西药毒性而越来越受到人们的重视[4]。本研究运用网络药理学研究将传统的中草药与现代药理学、生物信息学、分子生物学相结合,探讨夏天无治疗胃癌的有效成分及潜在机制,可能为复杂中药的机制研究提供研究策略。
1 材料与方法
1.1 夏天无潜在成药成分及对应靶点的确定
利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和分析平台(https: //old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)将口服生物利用度(oralbioavailability,OB)≥30%和类药性(drug-likeness,DL)≥0.18作为评价指标,筛选夏天无有效成分及对应靶点。中医药证候关联数据库和中医大百科全书(http: //www.tcmip.cn/ETCM/index.php/Home/Index/index.html)对靶点及对应的成分进行进一步合并筛选。Unitprot数据库(http: //www.Uniport.org/)用于翻译夏天无相关靶基因。
1.2 胃癌相关靶基因获取
将“gastric cancer”作 为 搜 索 关 键 词,在GeneCards数据库中进行检索 ......
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