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编号:112254
基于网络药理-分子对接探讨乌药治疗酒精性肝炎的作用机制
http://www.100md.com 2023年5月26日 中国医药科学 2023年第9期
靶标,靶点,1资料与方法,1乌药组分,2活性成分靶蛋白预测,3筛选疾病相关靶蛋白,4功能和通路富集分析,5靶蛋白相互作用分析,6药理学网络构建,7分子对接,2结果,1乌药活性成分,2活性成分的靶蛋白预测
     谭明明 张优妮 严聪聪 庞霄君 王军伟

    浙江省天台县人民医院,浙江天台 317200

    乌药(Lindera aggregata)系樟科山胡椒属植物,有行气止痛、温肾散寒之功,成分包括挥发油、倍半萜类化合物、异喹啉类生物碱、黄酮类、木脂素以及环戊二烯酮等[1]。研究表明,乌药可降低酒精性肝炎(alcoholic hepatitis,AH)模型大鼠血清丙氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶,缓解AH[2]。乌药可通过调节大鼠肠道菌群,抑制炎症反应,发挥保肝效应,机制与降低TLR4/NF-κB 通路的激活有关[3]。本研究基于网络药理学,筛选乌药的活性成分和潜在靶点,分析关键蛋白涉及的生物学功能及信号通路,构建“活性分子-靶点-通路”的网络药理图。通过分子对接技术,分析乌药活性成分与靶蛋白的相互作用,为进一步揭示乌药治疗AH 的药理机制提供理论基础。

    1 资料与方法

    1.1 乌药组分

    通 过TCMSP[4]以“乌 药”为 检 索 词,获 得乌药所有成分信息,设定筛选参数OB ≥30%、DL ≥0.1[5]。

    1.2 活性成分靶蛋白预测

    采用三种在线工具预测活性分子的靶蛋白,分别是:利用TCMSP 预测活性分子的靶蛋白,基于Uniprot[6]对蛋白名称进行Symbol 转化,利用BATMAN[7]预测活性分子对应的靶蛋白,并根据靶蛋白相互作用与已知靶点相似的可能性进行得分排序,设定Score cutoff=20。利用在线工具Swiss target prediction[8],预测化合物的靶标,设定筛选物种为“Homo sapiens”“Probability>0” ......

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