基于数据挖掘分析肝细胞癌中ATP柠檬酸裂解酶表达的临床意义
生存率,肝癌,1材料与方法,1UALCAN数据库挖掘方法,2GEPIA数据库挖掘方法,3HPA数据库,4STRING数据库,5统计学处理,2结果,1ACLY在肝癌组织中的表达,2ACLY表达与肝细胞癌
孙 岩 叶冬霞 杨 薇吉林省肝胆病医院中心实验室,吉林长春 130062
肝癌是常见的恶性肿瘤,其发病率居恶性肿瘤第5 位[1-2],主要以肝细胞癌为主。我国每年约34.4 万患者死于肝癌,占世界肝癌病死患者的55%[3-4]。肝细胞癌具有发病隐匿、进展快、易转移和恶性程度高的特点,大多数患者在首次确诊时已是晚期,无法通过手术切除,预后较差[5-6]。ATP 柠檬酸裂解酶(adenosine triphosphate citrate lyase,ACLY)将柠檬酸以及辅酶A 转化为乙酰辅酶A 和草酰乙酸,是脂肪酸代谢通路最上游的关键酶[7-8]。研究发现在肺癌、前列腺癌、膀胱癌、乳腺癌以及结肠癌等肿瘤中,ACLY 表达上调或激活[9],靶向抑制ACLY 成为一个潜在的研究热点。本研究应用多种数据库进行数据挖掘分析,探讨ACLY 在肝细胞癌中的表达差异和临床意义。
1 材料与方法
1.1 UALCAN数据库挖掘方法
使用UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu/)数据库检索分析ACLY mRNA 在肝癌组织和正常肝组织中表达及ACLY 基因表达与肝细胞癌患者临床病理指标和生存期的相关性。
1.2 GEPIA数据库挖掘方法
使用GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)数据库分析ACLY 在肝癌组织与正常肝组织中的表达及ACLY 表达对肝细胞癌患者总生存期和无病生存期的影响。
1.3 HPA数据库
使用HPA(http://www.Proteinatlas.org/)数据库分析正常肝组织和肝癌组织中ACLY 蛋白表达水平,Kaplan-Meier 生存分析评估患者的预后 ......
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