5-甲基胞嘧啶——高等生物的主要表观遗传标记
鸟嘌呤,腺嘌呤,引言,5mC和5hmC在基因表达调控中的基本作用,5mC表观遗传修饰标记的优越性,1生命活动的能量,2对细胞正常稳态的影响
刘卓 潘攀(张家港市第一人民医院肿瘤科 江苏 张家港 215600)
引言
DNA中碱基的化学修饰近年来一直是生命科学领域研究的热点之一。主要的DNA修饰包括腺嘌呤的甲基化和脱氨基,胞嘧啶的甲基化、羟甲基化和羧基取代,鸟嘌呤的氧化等,虽然这些修饰碱基的比例较低,但它们或者是细胞的生理活动所必需的,或者与细胞的病理发生密切相关,而且在物种间具有高度保守性和独特性[1]。DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤及7-甲基鸟嘌呤[2]。其中,胞嘧啶第5位碳原子上的甲基化动态修饰研究得较为深入。在上世纪早期,科学家首次用实验证明甲基化胞嘧啶是生物体内天然存在的化合物[3],修饰之后的碱基称为5-甲基胞嘧啶,简称为5mC。1951年,DNA中5mC的存在被Wyatt第一次报道[4]。
1.5mC和5hmC在基因表达调控中的基本作用
5mC是高等真核生物表观遗传修饰的主要形式,5hmC是5mC的羟基化形式,被称为DNA的第6种碱基,它最早于1952年在噬菌体DNA中被发现,它能被糖基转移酶介导糖基化修饰,从而使噬菌体基因组在进入宿主后能抵抗宿主限制酶的降解[5]。5hmC与5mC一样参与基因表达调控。一系列成果证实Tet1蛋白能调控CpG富集启动子处的DNA甲基化与羟甲基化水平,进而能促进干细胞中与多能性相关的因子的转录,使干细胞保持多能性[6]。为了具体探明甲基化与基因表达调控的关系,科学家在基因组层面测定了5mC和5hmC的存在位点[7],结果表明5mC主要导致基因的沉默,5hmC主要导致基因的激活,这可能因为5hmC是基因去甲基化的先兆。
在基因启动子区内CpG位点上,甲基化可能通过3种方式影响该基因转录活性[8]:
(1)DNA序列甲基化直接阻碍转录因子的结合 ......
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