lncRNA PVT1通过调控TGFβ通路的激活影响结肠癌细胞的增殖和侵袭
细胞株,材料和方法,1细胞株及相关材料,2组织样品,3miRNA提取和qPCR试验,4MTT增殖实验,5Transwell侵袭试验,6蛋白质印迹,7统计学分析,结果,1PVT1在结肠癌
魏蔚 杨淑改(1 新乡医学院 河南 新乡 453000)
(2 平顶山学院 河南 平顶山 467000)
随转录组测序技术的发展,大多数恶性肿瘤基因组DNA表现为缺乏蛋白质编码能力,从而导致加工转录过程更明确。长链非编码RNA是最近发现的一类主要类型的非编码RNA,其长度超过200个核苷酸[1]。近年来,不断有新出现的证据表明,一些lncRNA如PVT1在调节基因表达和调控基因表达方面发挥重要作用。通过表观遗传调控的生物学功能,包括甲基化,乙酰化和泛素化等相关作用[2]。
PVT1位于12q14.1上的基因位点,长度为1567nt,已被发现在多种人类恶性肿瘤中存在过表达情况。在非小细胞肺癌(NSCLC)中,PVT1的表达增加通过与表观遗传蛋白相互作用调节下游靶标的转录[3]。转化生长因子β(TGF-β)被定义为致癌蛋白,可以一定程度上促进肿瘤生长和转移,使其成为恶性肿瘤的预后和治疗靶点。此前,证明TGF-β在肝细胞癌中通过H3K27修饰进行表观遗传学调节[4]。然而,PVT1在结肠癌中与TGF-β的相互作用不甚清楚。
本实验通过假设lncRNA PVT1通过TGF-β通路蛋白表达影响结肠癌细胞的生物学行为。为了验证这一假设,首先明确PVT1在结肠癌组织和细胞系中的表达水平。通过进行体外和体内实验测定,进一步研究了PVT1在结肠癌的生物学功能相关性
1.材料和方法
1.1 细胞株及相关材料
人结肠癌细胞株HT-29,SW 480,SW620及RKO购买于上海中科院,RPMI-1640培养基和胰酶购买于美国Gibco公司;胎牛血清和双抗购买于美国海克隆公司;PBS磷酸盐缓冲液购买于美国Gibco公司。
1.2 组织样品
结肠癌组织收集2018年1月—8月经病理检查确诊为结肠癌组织50例。肿瘤组织离体后,去除血迹,放入4%多聚甲醛中固定。
1.3 miRNA提取和qPCR试验
使用来自TRIzol试剂按照制造商的说明分离来自组织或细胞系的miRNA ......
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