俞旭东 钱叶本(通讯作者)

    (安徽医科大学第一附属医院 安徽 合肥 230022)

    肝细胞癌是全球范围内发病率排名第六的癌症，并且是导致患者死亡的第四大最常见原因，其特点是高度增殖、异质性和侵袭性[1]。肝癌治疗方法多样，主要包括根治性切除术、肝移植术、射频消融术及放疗和化疗等方法。但其临床疗效有限，复发率高，肝癌患者的生存率较低[2,3]。目前肝癌缺乏特异性预后标志物。TCP1 环复合物是一种ATP 依赖性分子伴侣蛋白，其由八个不同的亚基(命名为CCT1 至CCT8)组成。TCP1 环复合物可以折叠肌动蛋白和微管蛋白，参与癌细胞的增殖，迁移[4-5]。作为TCP1 环复合物的亚基，CCT4 在恶性肿瘤中的作用鲜有报道。本文基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)公共数据库肝癌组织标本数据，利用生物信息学分析CCT4 在肝癌中的表达并使用PCR 和免疫组化验证；同时还分析了其异常表达在肝癌患者中的临床意义和其潜在机制。本文旨在阐明CCT4 在评估肝癌患者预后中的价值。

    1.资料和方法

    1.1 数据下载和处理

    从TCGA 数据库 (https：//tcga-data.nci.nih.gov/tcga/) 下载374 个HCC 组织和50 个正常肝组织样品的mRNA seqV2 表达谱数据和377 例HCC 患者的临床病理数据。下载的临床数据包括的指标为生存期、生存状态、年龄、性别、分级和TNM 分期。

    1.1.1 差 异 表 达 分 析 使 用limma 包(http：//bioconductor.org/packages/release/bioc/html/limma.html)分析CCT4 在TCGA 数据库中所包含的374 个HCC 组织和50 个正常肝组织样品中的表达差异。

    1.1.2 生存曲线 剔除TGCA 数据里中肝癌样本中生存数据不全的患者，剩余370 例患者。以CCT4 在这些组织中表达的中位值为截断值，将患者分为CCT4 高表达组和低表达组。使用survival 包(https：//cran.r-project.org/web/packages/survival/index.html)分析两组患者的总生存率 ......